Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NECTIN1Q15223 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NECTIN1Q15223 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NECTIN1Q15223 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NECTIN1Q15223 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NECTIN1Q15223 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NECTIN1Q15223 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
NECTIN1Q15223 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NECTIN1Q15223 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NECTIN1Q15223 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NECTIN1Q15223 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NECTIN1Q15223 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NECTIN1Q15223 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NECTIN1Q15223 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NECTIN1Q15223 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NECTIN1Q15223 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NECTIN1Q15223 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NECTIN1Q15223 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
NECTIN1Q15223 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NECTIN1Q15223 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NECTIN1Q15223 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NECTIN1Q15223 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NECTIN1Q15223 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NECTIN1Q15223 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NECTIN1Q15223 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NECTIN1Q15223 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NECTIN1Q15223 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NECTIN1Q15223 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NECTIN1Q15223 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NECTIN1Q15223 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NECTIN1Q15223 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NECTIN1Q15223 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NECTIN1Q15223 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NECTIN1Q15223 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NECTIN1Q15223 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NECTIN1Q15223 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NECTIN1Q15223 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NECTIN1Q15223 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NECTIN1Q15223 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NECTIN1Q15223 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NECTIN1Q15223 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NECTIN1Q15223 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NECTIN1Q15223 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NECTIN1Q15223 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NECTIN1Q15223 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NECTIN1Q15223 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NECTIN1Q15223 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NECTIN1Q15223 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NECTIN1Q15223 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
NECTIN1Q15223 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NECTIN1Q15223 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NECTIN1Q15223 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NECTIN1Q15223 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NECTIN1Q15223 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NECTIN1Q15223 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NECTIN1Q15223 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NECTIN1Q15223 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NECTIN1Q15223 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NECTIN1Q15223 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NECTIN1Q15223 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NECTIN1Q15223 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NECTIN1Q15223 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
NECTIN1Q15223 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NECTIN1Q15223 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NECTIN1Q15223 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NECTIN1Q15223 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NECTIN1Q15223 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NECTIN1Q15223 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NECTIN1Q15223 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NECTIN1Q15223 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NECTIN1Q15223 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
NECTIN1Q15223 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NECTIN1Q15223 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NECTIN1Q15223 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NECTIN1Q15223 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NECTIN1Q15223 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NECTIN1Q15223 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NECTIN1Q15223 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NECTIN1Q15223 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NECTIN1Q15223 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
NECTIN1Q15223 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NECTIN1Q15223 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NECTIN1Q15223 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NECTIN1Q15223 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NECTIN1Q15223 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NECTIN1Q15223 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NECTIN1Q15223 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NECTIN1Q15223 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NECTIN1Q15223 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NECTIN1Q15223 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NECTIN1Q15223 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NECTIN1Q15223 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NECTIN1Q15223 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NECTIN1Q15223 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NECTIN1Q15223 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NECTIN1Q15223 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NECTIN1Q15223 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NECTIN1Q15223 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NECTIN1Q15223 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NECTIN1Q15223 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152 ms