Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCD1Q15116 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCD1Q15116 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCD1Q15116 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCD1Q15116 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCD1Q15116 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCD1Q15116 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCD1Q15116 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCD1Q15116 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCD1Q15116 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCD1Q15116 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCD1Q15116 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCD1Q15116 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCD1Q15116 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCD1Q15116 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCD1Q15116 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCD1Q15116 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCD1Q15116 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCD1Q15116 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCD1Q15116 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCD1Q15116 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDCD1Q15116 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDCD1Q15116 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDCD1Q15116 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDCD1Q15116 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDCD1Q15116 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDCD1Q15116 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDCD1Q15116 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCD1Q15116 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCD1Q15116 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCD1Q15116 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCD1Q15116 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCD1Q15116 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCD1Q15116 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCD1Q15116 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCD1Q15116 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDCD1Q15116 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD1Q15116 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD1Q15116 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD1Q15116 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD1Q15116 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD1Q15116 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD1Q15116 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD1Q15116 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD1Q15116 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD1Q15116 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD1Q15116 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD1Q15116 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD1Q15116 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD1Q15116 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD1Q15116 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD1Q15116 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD1Q15116 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD1Q15116 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD1Q15116 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD1Q15116 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD1Q15116 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD1Q15116 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDCD1Q15116 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD1Q15116 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD1Q15116 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD1Q15116 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD1Q15116 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD1Q15116 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD1Q15116 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD1Q15116 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD1Q15116 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD1Q15116 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCD1Q15116 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCD1Q15116 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCD1Q15116 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCD1Q15116 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCD1Q15116 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCD1Q15116 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCD1Q15116 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCD1Q15116 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCD1Q15116 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCD1Q15116 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCD1Q15116 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCD1Q15116 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCD1Q15116 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCD1Q15116 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCD1Q15116 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCD1Q15116 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCD1Q15116 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCD1Q15116 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCD1Q15116 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCD1Q15116 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCD1Q15116 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCD1Q15116 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCD1Q15116 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCD1Q15116 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCD1Q15116 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCD1Q15116 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCD1Q15116 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCD1Q15116 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCD1Q15116 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCD1Q15116 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCD1Q15116 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCD1Q15116 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms