Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAPTM4AQ15012 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAPTM4AQ15012 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAPTM4AQ15012 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAPTM4AQ15012 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAPTM4AQ15012 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAPTM4AQ15012 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAPTM4AQ15012 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAPTM4AQ15012 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAPTM4AQ15012 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAPTM4AQ15012 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAPTM4AQ15012 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAPTM4AQ15012 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LAPTM4AQ15012 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAPTM4AQ15012 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAPTM4AQ15012 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAPTM4AQ15012 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAPTM4AQ15012 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAPTM4AQ15012 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAPTM4AQ15012 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAPTM4AQ15012 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAPTM4AQ15012 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
LAPTM4AQ15012 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAPTM4AQ15012 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAPTM4AQ15012 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAPTM4AQ15012 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAPTM4AQ15012 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAPTM4AQ15012 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAPTM4AQ15012 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAPTM4AQ15012 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAPTM4AQ15012 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAPTM4AQ15012 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAPTM4AQ15012 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAPTM4AQ15012 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAPTM4AQ15012 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAPTM4AQ15012 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAPTM4AQ15012 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAPTM4AQ15012 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAPTM4AQ15012 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAPTM4AQ15012 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAPTM4AQ15012 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAPTM4AQ15012 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAPTM4AQ15012 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAPTM4AQ15012 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAPTM4AQ15012 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAPTM4AQ15012 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAPTM4AQ15012 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAPTM4AQ15012 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAPTM4AQ15012 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAPTM4AQ15012 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAPTM4AQ15012 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAPTM4AQ15012 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAPTM4AQ15012 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAPTM4AQ15012 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAPTM4AQ15012 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAPTM4AQ15012 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAPTM4AQ15012 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAPTM4AQ15012 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LAPTM4AQ15012 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAPTM4AQ15012 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAPTM4AQ15012 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAPTM4AQ15012 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAPTM4AQ15012 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAPTM4AQ15012 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAPTM4AQ15012 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAPTM4AQ15012 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAPTM4AQ15012 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAPTM4AQ15012 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAPTM4AQ15012 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAPTM4AQ15012 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAPTM4AQ15012 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAPTM4AQ15012 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAPTM4AQ15012 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAPTM4AQ15012 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAPTM4AQ15012 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAPTM4AQ15012 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAPTM4AQ15012 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAPTM4AQ15012 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAPTM4AQ15012 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAPTM4AQ15012 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAPTM4AQ15012 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAPTM4AQ15012 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LAPTM4AQ15012 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAPTM4AQ15012 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAPTM4AQ15012 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAPTM4AQ15012 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAPTM4AQ15012 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAPTM4AQ15012 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LAPTM4AQ15012 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAPTM4AQ15012 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAPTM4AQ15012 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAPTM4AQ15012 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAPTM4AQ15012 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAPTM4AQ15012 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LAPTM4AQ15012 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAPTM4AQ15012 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAPTM4AQ15012 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAPTM4AQ15012 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAPTM4AQ15012 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAPTM4AQ15012 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
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