Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM29Q14134 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM29Q14134 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM29Q14134 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM29Q14134 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM29Q14134 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM29Q14134 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM29Q14134 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM29Q14134 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM29Q14134 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM29Q14134 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM29Q14134 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM29Q14134 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM29Q14134 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM29Q14134 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM29Q14134 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM29Q14134 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM29Q14134 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM29Q14134 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM29Q14134 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM29Q14134 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM29Q14134 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM29Q14134 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM29Q14134 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM29Q14134 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM29Q14134 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM29Q14134 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM29Q14134 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM29Q14134 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM29Q14134 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM29Q14134 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM29Q14134 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM29Q14134 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM29Q14134 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM29Q14134 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRIM29Q14134 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM29Q14134 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM29Q14134 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM29Q14134 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM29Q14134 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM29Q14134 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM29Q14134 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM29Q14134 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM29Q14134 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM29Q14134 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM29Q14134 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM29Q14134 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM29Q14134 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM29Q14134 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM29Q14134 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM29Q14134 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM29Q14134 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM29Q14134 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM29Q14134 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM29Q14134 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM29Q14134 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM29Q14134 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM29Q14134 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM29Q14134 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM29Q14134 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM29Q14134 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM29Q14134 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM29Q14134 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM29Q14134 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM29Q14134 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM29Q14134 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM29Q14134 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM29Q14134 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM29Q14134 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM29Q14134 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM29Q14134 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM29Q14134 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM29Q14134 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM29Q14134 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM29Q14134 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM29Q14134 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM29Q14134 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM29Q14134 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM29Q14134 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM29Q14134 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM29Q14134 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM29Q14134 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM29Q14134 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM29Q14134 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM29Q14134 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM29Q14134 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM29Q14134 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM29Q14134 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM29Q14134 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM29Q14134 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM29Q14134 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM29Q14134 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM29Q14134 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM29Q14134 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM29Q14134 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM29Q14134 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM29Q14134 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM29Q14134 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM29Q14134 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM29Q14134 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
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