Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNTB1Q13884 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNTB1Q13884 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNTB1Q13884 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNTB1Q13884 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNTB1Q13884 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNTB1Q13884 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNTB1Q13884 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNTB1Q13884 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNTB1Q13884 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNTB1Q13884 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNTB1Q13884 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNTB1Q13884 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNTB1Q13884 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNTB1Q13884 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNTB1Q13884 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNTB1Q13884 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNTB1Q13884 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNTB1Q13884 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTB1Q13884 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTB1Q13884 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNTB1Q13884 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNTB1Q13884 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNTB1Q13884 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNTB1Q13884 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNTB1Q13884 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNTB1Q13884 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNTB1Q13884 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNTB1Q13884 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNTB1Q13884 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNTB1Q13884 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNTB1Q13884 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNTB1Q13884 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNTB1Q13884 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNTB1Q13884 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNTB1Q13884 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNTB1Q13884 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNTB1Q13884 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNTB1Q13884 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNTB1Q13884 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNTB1Q13884 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNTB1Q13884 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNTB1Q13884 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNTB1Q13884 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNTB1Q13884 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNTB1Q13884 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNTB1Q13884 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNTB1Q13884 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNTB1Q13884 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNTB1Q13884 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNTB1Q13884 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNTB1Q13884 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNTB1Q13884 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNTB1Q13884 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNTB1Q13884 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNTB1Q13884 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNTB1Q13884 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNTB1Q13884 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNTB1Q13884 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNTB1Q13884 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNTB1Q13884 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNTB1Q13884 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNTB1Q13884 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNTB1Q13884 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNTB1Q13884 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNTB1Q13884 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNTB1Q13884 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNTB1Q13884 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNTB1Q13884 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNTB1Q13884 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNTB1Q13884 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNTB1Q13884 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNTB1Q13884 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNTB1Q13884 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNTB1Q13884 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNTB1Q13884 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNTB1Q13884 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNTB1Q13884 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNTB1Q13884 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNTB1Q13884 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNTB1Q13884 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNTB1Q13884 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNTB1Q13884 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNTB1Q13884 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNTB1Q13884 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SNTB1Q13884 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNTB1Q13884 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNTB1Q13884 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNTB1Q13884 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNTB1Q13884 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNTB1Q13884 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNTB1Q13884 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNTB1Q13884 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNTB1Q13884 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNTB1Q13884 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNTB1Q13884 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNTB1Q13884 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNTB1Q13884 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNTB1Q13884 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNTB1Q13884 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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