Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOFQ13790 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOFQ13790 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOFQ13790 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOFQ13790 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOFQ13790 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOFQ13790 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOFQ13790 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
APOFQ13790 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
APOFQ13790 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOFQ13790 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOFQ13790 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOFQ13790 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOFQ13790 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOFQ13790 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOFQ13790 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOFQ13790 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOFQ13790 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOFQ13790 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOFQ13790 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOFQ13790 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOFQ13790 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOFQ13790 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOFQ13790 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOFQ13790 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
APOFQ13790 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOFQ13790 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOFQ13790 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOFQ13790 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOFQ13790 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOFQ13790 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOFQ13790 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOFQ13790 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOFQ13790 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOFQ13790 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOFQ13790 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOFQ13790 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOFQ13790 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOFQ13790 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOFQ13790 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOFQ13790 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
APOFQ13790 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOFQ13790 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOFQ13790 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOFQ13790 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOFQ13790 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOFQ13790 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOFQ13790 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOFQ13790 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOFQ13790 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOFQ13790 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOFQ13790 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOFQ13790 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOFQ13790 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOFQ13790 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOFQ13790 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOFQ13790 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOFQ13790 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOFQ13790 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOFQ13790 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOFQ13790 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOFQ13790 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOFQ13790 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOFQ13790 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
APOFQ13790 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOFQ13790 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOFQ13790 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOFQ13790 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOFQ13790 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOFQ13790 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOFQ13790 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOFQ13790 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOFQ13790 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOFQ13790 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOFQ13790 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOFQ13790 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOFQ13790 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
APOFQ13790 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOFQ13790 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOFQ13790 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOFQ13790 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOFQ13790 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOFQ13790 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOFQ13790 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOFQ13790 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOFQ13790 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOFQ13790 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOFQ13790 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOFQ13790 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOFQ13790 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOFQ13790 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOFQ13790 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOFQ13790 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOFQ13790 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOFQ13790 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOFQ13790 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOFQ13790 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOFQ13790 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOFQ13790 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOFQ13790 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
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