Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CUL1Q13616 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CUL1Q13616 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CUL1Q13616 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CUL1Q13616 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CUL1Q13616 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CUL1Q13616 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CUL1Q13616 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CUL1Q13616 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CUL1Q13616 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CUL1Q13616 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CUL1Q13616 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CUL1Q13616 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CUL1Q13616 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CUL1Q13616 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CUL1Q13616 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CUL1Q13616 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CUL1Q13616 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CUL1Q13616 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CUL1Q13616 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CUL1Q13616 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CUL1Q13616 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CUL1Q13616 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CUL1Q13616 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CUL1Q13616 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CUL1Q13616 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CUL1Q13616 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CUL1Q13616 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CUL1Q13616 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CUL1Q13616 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CUL1Q13616 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CUL1Q13616 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CUL1Q13616 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CUL1Q13616 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CUL1Q13616 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CUL1Q13616 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CUL1Q13616 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CUL1Q13616 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CUL1Q13616 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CUL1Q13616 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CUL1Q13616 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CUL1Q13616 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CUL1Q13616 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CUL1Q13616 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CUL1Q13616 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CUL1Q13616 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CUL1Q13616 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUL1Q13616 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUL1Q13616 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUL1Q13616 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUL1Q13616 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CUL1Q13616 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CUL1Q13616 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CUL1Q13616 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CUL1Q13616 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CUL1Q13616 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CUL1Q13616 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CUL1Q13616 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CUL1Q13616 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CUL1Q13616 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CUL1Q13616 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CUL1Q13616 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CUL1Q13616 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CUL1Q13616 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CUL1Q13616 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CUL1Q13616 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CUL1Q13616 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CUL1Q13616 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CUL1Q13616 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CUL1Q13616 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CUL1Q13616 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CUL1Q13616 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CUL1Q13616 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CUL1Q13616 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CUL1Q13616 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CUL1Q13616 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CUL1Q13616 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CUL1Q13616 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CUL1Q13616 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CUL1Q13616 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CUL1Q13616 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CUL1Q13616 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CUL1Q13616 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CUL1Q13616 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CUL1Q13616 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CUL1Q13616 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CUL1Q13616 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CUL1Q13616 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CUL1Q13616 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CUL1Q13616 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CUL1Q13616 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CUL1Q13616 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CUL1Q13616 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CUL1Q13616 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CUL1Q13616 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CUL1Q13616 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CUL1Q13616 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CUL1Q13616 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CUL1Q13616 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CUL1Q13616 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
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