Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IKZF1Q13422 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IKZF1Q13422 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IKZF1Q13422 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IKZF1Q13422 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IKZF1Q13422 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IKZF1Q13422 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IKZF1Q13422 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IKZF1Q13422 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IKZF1Q13422 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IKZF1Q13422 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IKZF1Q13422 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IKZF1Q13422 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IKZF1Q13422 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IKZF1Q13422 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IKZF1Q13422 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IKZF1Q13422 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IKZF1Q13422 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
IKZF1Q13422 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IKZF1Q13422 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IKZF1Q13422 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IKZF1Q13422 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IKZF1Q13422 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IKZF1Q13422 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IKZF1Q13422 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IKZF1Q13422 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IKZF1Q13422 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IKZF1Q13422 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IKZF1Q13422 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IKZF1Q13422 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IKZF1Q13422 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IKZF1Q13422 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IKZF1Q13422 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IKZF1Q13422 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IKZF1Q13422 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IKZF1Q13422 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IKZF1Q13422 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IKZF1Q13422 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IKZF1Q13422 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
IKZF1Q13422 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IKZF1Q13422 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IKZF1Q13422 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
IKZF1Q13422 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IKZF1Q13422 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IKZF1Q13422 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IKZF1Q13422 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IKZF1Q13422 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IKZF1Q13422 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IKZF1Q13422 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKZF1Q13422 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKZF1Q13422 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKZF1Q13422 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKZF1Q13422 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKZF1Q13422 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKZF1Q13422 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKZF1Q13422 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
IKZF1Q13422 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKZF1Q13422 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKZF1Q13422 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKZF1Q13422 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
IKZF1Q13422 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
IKZF1Q13422 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IKZF1Q13422 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IKZF1Q13422 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IKZF1Q13422 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IKZF1Q13422 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IKZF1Q13422 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IKZF1Q13422 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IKZF1Q13422 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IKZF1Q13422 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
IKZF1Q13422 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IKZF1Q13422 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IKZF1Q13422 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
IKZF1Q13422 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IKZF1Q13422 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IKZF1Q13422 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IKZF1Q13422 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IKZF1Q13422 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IKZF1Q13422 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IKZF1Q13422 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IKZF1Q13422 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IKZF1Q13422 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IKZF1Q13422 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IKZF1Q13422 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IKZF1Q13422 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IKZF1Q13422 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IKZF1Q13422 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IKZF1Q13422 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IKZF1Q13422 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IKZF1Q13422 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IKZF1Q13422 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IKZF1Q13422 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IKZF1Q13422 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IKZF1Q13422 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IKZF1Q13422 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IKZF1Q13422 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IKZF1Q13422 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
IKZF1Q13422 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IKZF1Q13422 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IKZF1Q13422 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms