Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2V1Q13404 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2V1Q13404 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
UBE2V1Q13404 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2V1Q13404 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2V1Q13404 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2V1Q13404 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2V1Q13404 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2V1Q13404 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2V1Q13404 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2V1Q13404 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2V1Q13404 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2V1Q13404 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2V1Q13404 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2V1Q13404 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2V1Q13404 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2V1Q13404 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2V1Q13404 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2V1Q13404 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2V1Q13404 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2V1Q13404 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2V1Q13404 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE2V1Q13404 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE2V1Q13404 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE2V1Q13404 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE2V1Q13404 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBE2V1Q13404 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBE2V1Q13404 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
UBE2V1Q13404 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2V1Q13404 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2V1Q13404 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2V1Q13404 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2V1Q13404 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBE2V1Q13404 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2V1Q13404 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2V1Q13404 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2V1Q13404 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2V1Q13404 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2V1Q13404 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2V1Q13404 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE2V1Q13404 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2V1Q13404 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2V1Q13404 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2V1Q13404 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2V1Q13404 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2V1Q13404 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2V1Q13404 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2V1Q13404 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2V1Q13404 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2V1Q13404 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2V1Q13404 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2V1Q13404 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2V1Q13404 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2V1Q13404 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2V1Q13404 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2V1Q13404 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2V1Q13404 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBE2V1Q13404 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2V1Q13404 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2V1Q13404 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2V1Q13404 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2V1Q13404 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2V1Q13404 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2V1Q13404 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2V1Q13404 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2V1Q13404 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2V1Q13404 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2V1Q13404 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2V1Q13404 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2V1Q13404 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2V1Q13404 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2V1Q13404 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2V1Q13404 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2V1Q13404 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2V1Q13404 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2V1Q13404 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2V1Q13404 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2V1Q13404 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2V1Q13404 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2V1Q13404 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2V1Q13404 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2V1Q13404 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2V1Q13404 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2V1Q13404 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2V1Q13404 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2V1Q13404 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2V1Q13404 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2V1Q13404 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2V1Q13404 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2V1Q13404 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2V1Q13404 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2V1Q13404 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE2V1Q13404 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2V1Q13404 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2V1Q13404 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2V1Q13404 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2V1Q13404 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2V1Q13404 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2V1Q13404 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2V1Q13404 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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