Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 EPS15L1-215ENST00000602022 3082 ntTSL 1 (best)15.18■□□□□ 0.022e-6■■■■□ 24
G3BP1Q13283 EPS15L1-205ENST00000593760 583 ntTSL 414.2□□□□□ -0.142e-6■■■■□ 24
G3BP1Q13283 EPS15L1-204ENST00000592031 2788 ntTSL 213.03□□□□□ -0.322e-6■■■■□ 24
G3BP1Q13283 EPS15L1-203ENST00000535753 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.422e-6■■■■□ 24
G3BP1Q13283 EPS15L1-212ENST00000597937 3486 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.582e-6■■■■□ 24
G3BP1Q13283 EPS15L1-214ENST00000602009 3915 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.82e-6■■■■□ 24
G3BP1Q13283 PSMD2-217ENST00000491149 895 ntTSL 211.32□□□□□ -0.65e-7■■■■□ 24
G3BP1Q13283 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.82e-7■■■■□ 24
G3BP1Q13283 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.013e-9■■■■□ 24
G3BP1Q13283 CCDC86-202ENST00000535217 1488 ntTSL 521.29■■□□□ 12e-8■■■■□ 24
G3BP1Q13283 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.312e-8■■■■□ 24
G3BP1Q13283 PDCD11-201ENST00000369797 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.25e-7■■■■□ 24
G3BP1Q13283 JAK1-201ENST00000342505 5047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.241e-6■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.564e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.487e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.237e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 PHF14-214ENST00000521747 2479 ntTSL 227.76■■■□□ 2.037e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 PHF14-202ENST00000423760 2627 ntTSL 226.02■■□□□ 1.767e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 ARAP1-212ENST00000536885 639 ntTSL 224.15■■□□□ 1.467e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 PHF14-206ENST00000476009 1044 ntTSL 323.71■■□□□ 1.397e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.347e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 WDR81-203ENST00000418841 582 ntTSL 323.03■■□□□ 1.287e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 ANAPC2-203ENST00000483432 793 ntTSL 222.12■■□□□ 1.137e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 POLD1-211ENST00000600746 999 ntTSL 521.71■■□□□ 1.077e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.967e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 POLD1-213ENST00000601098 783 ntTSL 320.35■□□□□ 0.857e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.837e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 ARAP1-214ENST00000541623 533 ntTSL 519.88■□□□□ 0.777e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 POLD1-203ENST00000593887 695 ntTSL 519.82■□□□□ 0.767e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.727e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 SPG7-204ENST00000561911 1025 ntTSL 519.49■□□□□ 0.717e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 SPG7-218ENST00000568205 463 ntTSL 219.49■□□□□ 0.717e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 ILK-207ENST00000526711 1594 ntTSL 219.4■□□□□ 0.77e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 WDR81-214ENST00000575206 590 ntTSL 319.12■□□□□ 0.657e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.657e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.647e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 WDR81-209ENST00000468539 562 ntTSL 418.7■□□□□ 0.587e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 SPG7-213ENST00000566221 734 ntTSL 318.33■□□□□ 0.527e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 WDR81-212ENST00000492901 545 ntTSL 417.86■□□□□ 0.457e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.447e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 PHF14-210ENST00000490957 4058 ntTSL 517.82■□□□□ 0.447e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.397e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 SPG7-203ENST00000561702 2042 ntTSL 217.37■□□□□ 0.377e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 WDR81-207ENST00000455636 570 ntTSL 317.12■□□□□ 0.337e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.327e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.277e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.237e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 POLD1-212ENST00000600859 3474 ntTSL 216.48■□□□□ 0.237e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 COG4-214ENST00000567244 723 ntTSL 316.22■□□□□ 0.197e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.167e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.167e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.137e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 ILK-211ENST00000530016 1696 ntTSL 215.42■□□□□ 0.067e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 SPG7-211ENST00000565370 686 ntTSL 315.21■□□□□ 0.037e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 WDR81-201ENST00000309182 3808 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.017e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 WDR81-208ENST00000464528 4432 ntTSL 215.06■□□□□ 07e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 ILK-215ENST00000537806 1801 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.17e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 LANCL1-206ENST00000448951 808 ntTSL 314.39□□□□□ -0.117e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 SPG7-222ENST00000569820 2305 ntTSL 514.25□□□□□ -0.137e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 COG4-205ENST00000526700 1978 ntTSL 514.24□□□□□ -0.137e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 CNDP2-215ENST00000581912 551 ntTSL 413.59□□□□□ -0.237e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 ILK-210ENST00000528995 1559 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.287e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 ILK-202ENST00000396751 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.37e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 ILK-214ENST00000534706 790 ntTSL 512.8□□□□□ -0.367e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 ILK-206ENST00000526318 596 ntTSL 312.77□□□□□ -0.377e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 GLOD4-209ENST00000574581 677 ntTSL 311.87□□□□□ -0.517e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 PSMA3-207ENST00000554812 1279 ntTSL 211.09□□□□□ -0.637e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 ILK-209ENST00000528784 947 ntTSL 211.07□□□□□ -0.647e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.997e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 PSMA3-203ENST00000553665 925 ntTSL 28.3□□□□□ -1.087e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 PSMA3-209ENST00000555931 606 ntTSL 48.05□□□□□ -1.127e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 PSMA3-208ENST00000555743 640 ntTSL 27.63□□□□□ -1.197e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 ANXA4-203ENST00000418066 905 ntTSL 37.58□□□□□ -1.27e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.217e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 OSBP-202ENST00000525357 991 ntTSL 1 (best)6.89□□□□□ -1.317e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.347e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 PSMA3-210ENST00000556321 500 ntTSL 25.76□□□□□ -1.497e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.577e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 PSMA3-211ENST00000557087 654 ntTSL 34.54□□□□□ -1.687e-7■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 NCAPD2-204ENST00000536090 654 ntTSL 214.32□□□□□ -0.125e-23■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 NCAPD2-211ENST00000542472 444 ntTSL 34.53□□□□□ -1.685e-23■■■■□ 23.9
G3BP1Q13283 CLTC-203ENST00000466513 793 ntTSL 25.53□□□□□ -1.522e-7■■■■□ 23.8
G3BP1Q13283 HSD17B4-211ENST00000508788 446 ntTSL 47.71□□□□□ -1.181e-6■■■■□ 23.8
G3BP1Q13283 HSD17B4-207ENST00000505181 417 ntTSL 57.35□□□□□ -1.231e-6■■■■□ 23.8
G3BP1Q13283 CLTC-207ENST00000483176 760 ntTSL 35.9□□□□□ -1.464e-10■■■■□ 23.8
G3BP1Q13283 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.472e-11■■■■□ 23.8
G3BP1Q13283 PHGDH-234ENST00000642041 943 nt21■□□□□ 0.956e-8■■■■□ 23.8
G3BP1Q13283 PHGDH-221ENST00000641573 1180 nt16.15■□□□□ 0.186e-8■■■■□ 23.8
G3BP1Q13283 PSMB3-211ENST00000619426 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.098e-10■■■■□ 23.7
G3BP1Q13283 PSMB3-208ENST00000613870 662 ntTSL 310.38□□□□□ -0.758e-10■■■■□ 23.7
G3BP1Q13283 PSMB3-212ENST00000620309 552 ntTSL 28.68□□□□□ -1.028e-10■■■■□ 23.7
G3BP1Q13283 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.738e-8■■■■□ 23.7
G3BP1Q13283 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.988e-8■■■■□ 23.7
G3BP1Q13283 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.638e-8■■■■□ 23.7
G3BP1Q13283 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.518e-8■■■■□ 23.7
G3BP1Q13283 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.58e-8■■■■□ 23.7
G3BP1Q13283 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.288e-8■■■■□ 23.7
G3BP1Q13283 NSFL1C-203ENST00000381653 1446 ntTSL 527■■□□□ 1.914e-7■■■■□ 23.7
G3BP1Q13283 NSFL1C-205ENST00000470376 845 ntTSL 326.82■■□□□ 1.884e-7■■■■□ 23.7
G3BP1Q13283 NSFL1C-212ENST00000555568 863 ntTSL 322.23■■□□□ 1.154e-7■■■■□ 23.7
Retrieved 100 of 11,245 protein–RNA pairs in 490.7 ms