Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKAA1Q13131 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKAA1Q13131 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKAA1Q13131 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKAA1Q13131 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKAA1Q13131 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKAA1Q13131 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKAA1Q13131 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKAA1Q13131 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKAA1Q13131 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKAA1Q13131 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKAA1Q13131 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKAA1Q13131 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKAA1Q13131 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKAA1Q13131 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKAA1Q13131 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKAA1Q13131 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKAA1Q13131 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKAA1Q13131 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKAA1Q13131 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKAA1Q13131 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKAA1Q13131 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKAA1Q13131 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKAA1Q13131 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKAA1Q13131 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRKAA1Q13131 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKAA1Q13131 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKAA1Q13131 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKAA1Q13131 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKAA1Q13131 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKAA1Q13131 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKAA1Q13131 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKAA1Q13131 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKAA1Q13131 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKAA1Q13131 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAA1Q13131 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAA1Q13131 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAA1Q13131 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAA1Q13131 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAA1Q13131 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAA1Q13131 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKAA1Q13131 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKAA1Q13131 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKAA1Q13131 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKAA1Q13131 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKAA1Q13131 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKAA1Q13131 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKAA1Q13131 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKAA1Q13131 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKAA1Q13131 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKAA1Q13131 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKAA1Q13131 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKAA1Q13131 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKAA1Q13131 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKAA1Q13131 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKAA1Q13131 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKAA1Q13131 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKAA1Q13131 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKAA1Q13131 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKAA1Q13131 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKAA1Q13131 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKAA1Q13131 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKAA1Q13131 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKAA1Q13131 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKAA1Q13131 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKAA1Q13131 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKAA1Q13131 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKAA1Q13131 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKAA1Q13131 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKAA1Q13131 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKAA1Q13131 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKAA1Q13131 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKAA1Q13131 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKAA1Q13131 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKAA1Q13131 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKAA1Q13131 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKAA1Q13131 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKAA1Q13131 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKAA1Q13131 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKAA1Q13131 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKAA1Q13131 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKAA1Q13131 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKAA1Q13131 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRKAA1Q13131 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRKAA1Q13131 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKAA1Q13131 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKAA1Q13131 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKAA1Q13131 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKAA1Q13131 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKAA1Q13131 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKAA1Q13131 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKAA1Q13131 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKAA1Q13131 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKAA1Q13131 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKAA1Q13131 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKAA1Q13131 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKAA1Q13131 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKAA1Q13131 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKAA1Q13131 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKAA1Q13131 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
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