Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

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Length 1,914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RLFQ13129 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RLFQ13129 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RLFQ13129 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RLFQ13129 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RLFQ13129 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RLFQ13129 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RLFQ13129 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RLFQ13129 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
RLFQ13129 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
RLFQ13129 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RLFQ13129 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RLFQ13129 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RLFQ13129 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RLFQ13129 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RLFQ13129 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RLFQ13129 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RLFQ13129 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RLFQ13129 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RLFQ13129 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RLFQ13129 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RLFQ13129 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RLFQ13129 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
RLFQ13129 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RLFQ13129 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
RLFQ13129 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RLFQ13129 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RLFQ13129 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RLFQ13129 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RLFQ13129 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RLFQ13129 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RLFQ13129 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RLFQ13129 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RLFQ13129 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RLFQ13129 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RLFQ13129 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RLFQ13129 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RLFQ13129 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RLFQ13129 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RLFQ13129 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RLFQ13129 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RLFQ13129 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RLFQ13129 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
RLFQ13129 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RLFQ13129 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RLFQ13129 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RLFQ13129 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RLFQ13129 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RLFQ13129 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RLFQ13129 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RLFQ13129 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RLFQ13129 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RLFQ13129 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RLFQ13129 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RLFQ13129 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RLFQ13129 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RLFQ13129 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RLFQ13129 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RLFQ13129 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RLFQ13129 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RLFQ13129 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RLFQ13129 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RLFQ13129 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RLFQ13129 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RLFQ13129 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RLFQ13129 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RLFQ13129 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RLFQ13129 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RLFQ13129 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RLFQ13129 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RLFQ13129 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RLFQ13129 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RLFQ13129 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RLFQ13129 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RLFQ13129 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RLFQ13129 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RLFQ13129 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RLFQ13129 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
RLFQ13129 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RLFQ13129 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RLFQ13129 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RLFQ13129 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RLFQ13129 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RLFQ13129 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RLFQ13129 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RLFQ13129 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RLFQ13129 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RLFQ13129 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RLFQ13129 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
RLFQ13129 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
RLFQ13129 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RLFQ13129 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RLFQ13129 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RLFQ13129 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RLFQ13129 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RLFQ13129 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RLFQ13129 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RLFQ13129 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RLFQ13129 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RLFQ13129 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
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