Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX4Q12846 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX4Q12846 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX4Q12846 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX4Q12846 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX4Q12846 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX4Q12846 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STX4Q12846 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STX4Q12846 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STX4Q12846 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
STX4Q12846 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
STX4Q12846 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STX4Q12846 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STX4Q12846 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STX4Q12846 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STX4Q12846 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STX4Q12846 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STX4Q12846 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STX4Q12846 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STX4Q12846 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STX4Q12846 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STX4Q12846 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STX4Q12846 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STX4Q12846 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
STX4Q12846 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STX4Q12846 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STX4Q12846 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STX4Q12846 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STX4Q12846 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STX4Q12846 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STX4Q12846 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STX4Q12846 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STX4Q12846 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STX4Q12846 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STX4Q12846 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STX4Q12846 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STX4Q12846 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STX4Q12846 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STX4Q12846 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STX4Q12846 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
STX4Q12846 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
STX4Q12846 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
STX4Q12846 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
STX4Q12846 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
STX4Q12846 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STX4Q12846 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STX4Q12846 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STX4Q12846 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
STX4Q12846 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
STX4Q12846 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STX4Q12846 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STX4Q12846 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STX4Q12846 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STX4Q12846 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STX4Q12846 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STX4Q12846 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
STX4Q12846 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STX4Q12846 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STX4Q12846 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STX4Q12846 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STX4Q12846 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STX4Q12846 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
STX4Q12846 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STX4Q12846 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STX4Q12846 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STX4Q12846 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STX4Q12846 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STX4Q12846 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STX4Q12846 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STX4Q12846 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STX4Q12846 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STX4Q12846 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STX4Q12846 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STX4Q12846 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STX4Q12846 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STX4Q12846 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
STX4Q12846 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STX4Q12846 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STX4Q12846 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STX4Q12846 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STX4Q12846 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STX4Q12846 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STX4Q12846 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
STX4Q12846 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STX4Q12846 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STX4Q12846 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STX4Q12846 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STX4Q12846 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
STX4Q12846 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STX4Q12846 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STX4Q12846 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STX4Q12846 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STX4Q12846 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STX4Q12846 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
STX4Q12846 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STX4Q12846 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STX4Q12846 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STX4Q12846 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STX4Q12846 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STX4Q12846 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
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