Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC173Q0VFZ6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC173Q0VFZ6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC173Q0VFZ6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC173Q0VFZ6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC173Q0VFZ6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC173Q0VFZ6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC173Q0VFZ6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC173Q0VFZ6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC173Q0VFZ6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC173Q0VFZ6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC173Q0VFZ6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC173Q0VFZ6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC173Q0VFZ6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC173Q0VFZ6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC173Q0VFZ6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC173Q0VFZ6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC173Q0VFZ6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC173Q0VFZ6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC173Q0VFZ6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC173Q0VFZ6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC173Q0VFZ6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC173Q0VFZ6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC173Q0VFZ6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC173Q0VFZ6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC173Q0VFZ6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC173Q0VFZ6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC173Q0VFZ6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC173Q0VFZ6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC173Q0VFZ6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC173Q0VFZ6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC173Q0VFZ6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC173Q0VFZ6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC173Q0VFZ6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC173Q0VFZ6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC173Q0VFZ6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC173Q0VFZ6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC173Q0VFZ6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC173Q0VFZ6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC173Q0VFZ6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC173Q0VFZ6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC173Q0VFZ6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC173Q0VFZ6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC173Q0VFZ6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC173Q0VFZ6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC173Q0VFZ6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC173Q0VFZ6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC173Q0VFZ6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC173Q0VFZ6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC173Q0VFZ6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC173Q0VFZ6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC173Q0VFZ6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC173Q0VFZ6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC173Q0VFZ6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC173Q0VFZ6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC173Q0VFZ6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC173Q0VFZ6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC173Q0VFZ6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC173Q0VFZ6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC173Q0VFZ6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC173Q0VFZ6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC173Q0VFZ6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC173Q0VFZ6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC173Q0VFZ6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC173Q0VFZ6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC173Q0VFZ6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC173Q0VFZ6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC173Q0VFZ6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC173Q0VFZ6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC173Q0VFZ6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC173Q0VFZ6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC173Q0VFZ6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC173Q0VFZ6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC173Q0VFZ6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC173Q0VFZ6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC173Q0VFZ6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC173Q0VFZ6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC173Q0VFZ6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC173Q0VFZ6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC173Q0VFZ6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC173Q0VFZ6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC173Q0VFZ6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC173Q0VFZ6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC173Q0VFZ6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC173Q0VFZ6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC173Q0VFZ6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC173Q0VFZ6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC173Q0VFZ6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC173Q0VFZ6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC173Q0VFZ6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC173Q0VFZ6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC173Q0VFZ6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC173Q0VFZ6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC173Q0VFZ6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC173Q0VFZ6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC173Q0VFZ6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC173Q0VFZ6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC173Q0VFZ6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC173Q0VFZ6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC173Q0VFZ6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.2 ms