Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
DHX9Q08211 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DHX9Q08211 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DHX9Q08211 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DHX9Q08211 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DHX9Q08211 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DHX9Q08211 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DHX9Q08211 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DHX9Q08211 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DHX9Q08211 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DHX9Q08211 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DHX9Q08211 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DHX9Q08211 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DHX9Q08211 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DHX9Q08211 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DHX9Q08211 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DHX9Q08211 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DHX9Q08211 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DHX9Q08211 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DHX9Q08211 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DHX9Q08211 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DHX9Q08211 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DHX9Q08211 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DHX9Q08211 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DHX9Q08211 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DHX9Q08211 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DHX9Q08211 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DHX9Q08211 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DHX9Q08211 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DHX9Q08211 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
DHX9Q08211 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DHX9Q08211 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DHX9Q08211 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DHX9Q08211 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DHX9Q08211 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DHX9Q08211 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DHX9Q08211 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DHX9Q08211 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DHX9Q08211 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DHX9Q08211 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DHX9Q08211 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DHX9Q08211 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DHX9Q08211 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DHX9Q08211 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DHX9Q08211 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DHX9Q08211 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DHX9Q08211 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DHX9Q08211 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DHX9Q08211 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DHX9Q08211 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DHX9Q08211 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DHX9Q08211 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DHX9Q08211 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DHX9Q08211 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DHX9Q08211 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DHX9Q08211 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DHX9Q08211 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DHX9Q08211 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DHX9Q08211 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DHX9Q08211 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DHX9Q08211 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DHX9Q08211 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DHX9Q08211 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DHX9Q08211 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DHX9Q08211 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DHX9Q08211 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DHX9Q08211 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DHX9Q08211 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DHX9Q08211 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DHX9Q08211 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DHX9Q08211 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DHX9Q08211 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
DHX9Q08211 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DHX9Q08211 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DHX9Q08211 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DHX9Q08211 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
DHX9Q08211 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DHX9Q08211 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DHX9Q08211 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DHX9Q08211 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DHX9Q08211 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DHX9Q08211 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DHX9Q08211 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DHX9Q08211 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DHX9Q08211 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DHX9Q08211 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DHX9Q08211 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DHX9Q08211 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DHX9Q08211 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DHX9Q08211 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DHX9Q08211 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DHX9Q08211 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DHX9Q08211 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DHX9Q08211 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DHX9Q08211 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DHX9Q08211 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DHX9Q08211 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DHX9Q08211 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DHX9Q08211 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DHX9Q08211 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms