Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLCB3Q01970 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLCB3Q01970 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PLCB3Q01970 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLCB3Q01970 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLCB3Q01970 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PLCB3Q01970 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLCB3Q01970 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLCB3Q01970 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLCB3Q01970 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLCB3Q01970 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLCB3Q01970 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PLCB3Q01970 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PLCB3Q01970 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PLCB3Q01970 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PLCB3Q01970 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PLCB3Q01970 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PLCB3Q01970 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLCB3Q01970 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLCB3Q01970 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLCB3Q01970 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLCB3Q01970 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PLCB3Q01970 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PLCB3Q01970 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PLCB3Q01970 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PLCB3Q01970 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PLCB3Q01970 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PLCB3Q01970 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PLCB3Q01970 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PLCB3Q01970 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PLCB3Q01970 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PLCB3Q01970 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PLCB3Q01970 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PLCB3Q01970 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLCB3Q01970 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLCB3Q01970 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLCB3Q01970 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLCB3Q01970 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLCB3Q01970 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLCB3Q01970 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLCB3Q01970 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLCB3Q01970 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLCB3Q01970 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLCB3Q01970 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLCB3Q01970 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PLCB3Q01970 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLCB3Q01970 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLCB3Q01970 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLCB3Q01970 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLCB3Q01970 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLCB3Q01970 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLCB3Q01970 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PLCB3Q01970 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PLCB3Q01970 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PLCB3Q01970 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PLCB3Q01970 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PLCB3Q01970 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PLCB3Q01970 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PLCB3Q01970 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PLCB3Q01970 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PLCB3Q01970 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PLCB3Q01970 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PLCB3Q01970 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PLCB3Q01970 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PLCB3Q01970 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PLCB3Q01970 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLCB3Q01970 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLCB3Q01970 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PLCB3Q01970 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PLCB3Q01970 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLCB3Q01970 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLCB3Q01970 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLCB3Q01970 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PLCB3Q01970 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PLCB3Q01970 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLCB3Q01970 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLCB3Q01970 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLCB3Q01970 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PLCB3Q01970 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLCB3Q01970 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLCB3Q01970 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLCB3Q01970 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLCB3Q01970 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLCB3Q01970 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLCB3Q01970 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLCB3Q01970 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLCB3Q01970 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PLCB3Q01970 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PLCB3Q01970 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLCB3Q01970 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLCB3Q01970 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLCB3Q01970 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLCB3Q01970 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLCB3Q01970 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PLCB3Q01970 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLCB3Q01970 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLCB3Q01970 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PLCB3Q01970 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLCB3Q01970 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLCB3Q01970 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms