Protein–RNA interactions for Protein: Q01459

CTBS, Di-N-acetylchitobiase, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBSQ01459 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTBSQ01459 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTBSQ01459 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTBSQ01459 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTBSQ01459 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTBSQ01459 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTBSQ01459 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTBSQ01459 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTBSQ01459 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTBSQ01459 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTBSQ01459 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTBSQ01459 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTBSQ01459 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTBSQ01459 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTBSQ01459 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTBSQ01459 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTBSQ01459 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CTBSQ01459 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTBSQ01459 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTBSQ01459 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTBSQ01459 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTBSQ01459 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTBSQ01459 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTBSQ01459 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CTBSQ01459 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTBSQ01459 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTBSQ01459 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTBSQ01459 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTBSQ01459 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTBSQ01459 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTBSQ01459 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTBSQ01459 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTBSQ01459 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTBSQ01459 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTBSQ01459 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTBSQ01459 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTBSQ01459 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTBSQ01459 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTBSQ01459 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTBSQ01459 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTBSQ01459 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTBSQ01459 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTBSQ01459 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTBSQ01459 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTBSQ01459 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTBSQ01459 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTBSQ01459 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTBSQ01459 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTBSQ01459 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTBSQ01459 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTBSQ01459 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTBSQ01459 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTBSQ01459 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTBSQ01459 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTBSQ01459 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTBSQ01459 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTBSQ01459 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTBSQ01459 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CTBSQ01459 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTBSQ01459 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CTBSQ01459 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CTBSQ01459 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTBSQ01459 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTBSQ01459 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTBSQ01459 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTBSQ01459 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTBSQ01459 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTBSQ01459 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CTBSQ01459 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTBSQ01459 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTBSQ01459 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTBSQ01459 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTBSQ01459 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTBSQ01459 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CTBSQ01459 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTBSQ01459 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CTBSQ01459 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTBSQ01459 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTBSQ01459 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTBSQ01459 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTBSQ01459 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTBSQ01459 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTBSQ01459 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTBSQ01459 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTBSQ01459 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTBSQ01459 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTBSQ01459 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTBSQ01459 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CTBSQ01459 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTBSQ01459 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTBSQ01459 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTBSQ01459 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTBSQ01459 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTBSQ01459 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTBSQ01459 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTBSQ01459 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTBSQ01459 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTBSQ01459 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTBSQ01459 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTBSQ01459 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms