Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD83Q01151 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD83Q01151 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD83Q01151 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD83Q01151 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD83Q01151 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD83Q01151 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD83Q01151 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD83Q01151 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD83Q01151 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD83Q01151 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD83Q01151 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD83Q01151 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD83Q01151 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD83Q01151 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD83Q01151 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD83Q01151 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD83Q01151 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD83Q01151 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD83Q01151 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD83Q01151 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD83Q01151 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD83Q01151 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD83Q01151 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD83Q01151 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD83Q01151 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD83Q01151 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD83Q01151 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD83Q01151 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD83Q01151 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CD83Q01151 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD83Q01151 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD83Q01151 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD83Q01151 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD83Q01151 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD83Q01151 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD83Q01151 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD83Q01151 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD83Q01151 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD83Q01151 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD83Q01151 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD83Q01151 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD83Q01151 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD83Q01151 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD83Q01151 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD83Q01151 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD83Q01151 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD83Q01151 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD83Q01151 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD83Q01151 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD83Q01151 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD83Q01151 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD83Q01151 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD83Q01151 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD83Q01151 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD83Q01151 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD83Q01151 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD83Q01151 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD83Q01151 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD83Q01151 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD83Q01151 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD83Q01151 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD83Q01151 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD83Q01151 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CD83Q01151 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CD83Q01151 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD83Q01151 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CD83Q01151 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD83Q01151 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD83Q01151 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD83Q01151 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD83Q01151 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD83Q01151 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD83Q01151 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD83Q01151 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD83Q01151 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD83Q01151 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD83Q01151 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD83Q01151 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD83Q01151 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD83Q01151 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD83Q01151 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD83Q01151 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD83Q01151 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD83Q01151 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD83Q01151 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CD83Q01151 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CD83Q01151 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CD83Q01151 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD83Q01151 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD83Q01151 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD83Q01151 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD83Q01151 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD83Q01151 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD83Q01151 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD83Q01151 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD83Q01151 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD83Q01151 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD83Q01151 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD83Q01151 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms