Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VLDLRP98155 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VLDLRP98155 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VLDLRP98155 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VLDLRP98155 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VLDLRP98155 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VLDLRP98155 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VLDLRP98155 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VLDLRP98155 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VLDLRP98155 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VLDLRP98155 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VLDLRP98155 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VLDLRP98155 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VLDLRP98155 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VLDLRP98155 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VLDLRP98155 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VLDLRP98155 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VLDLRP98155 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VLDLRP98155 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VLDLRP98155 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VLDLRP98155 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VLDLRP98155 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VLDLRP98155 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VLDLRP98155 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VLDLRP98155 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VLDLRP98155 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VLDLRP98155 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VLDLRP98155 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VLDLRP98155 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VLDLRP98155 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VLDLRP98155 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VLDLRP98155 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VLDLRP98155 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VLDLRP98155 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VLDLRP98155 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VLDLRP98155 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VLDLRP98155 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VLDLRP98155 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VLDLRP98155 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VLDLRP98155 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VLDLRP98155 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VLDLRP98155 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VLDLRP98155 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VLDLRP98155 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VLDLRP98155 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VLDLRP98155 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VLDLRP98155 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VLDLRP98155 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VLDLRP98155 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VLDLRP98155 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VLDLRP98155 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VLDLRP98155 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VLDLRP98155 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VLDLRP98155 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VLDLRP98155 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VLDLRP98155 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VLDLRP98155 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VLDLRP98155 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VLDLRP98155 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VLDLRP98155 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VLDLRP98155 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VLDLRP98155 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VLDLRP98155 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VLDLRP98155 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VLDLRP98155 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VLDLRP98155 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VLDLRP98155 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VLDLRP98155 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VLDLRP98155 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VLDLRP98155 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VLDLRP98155 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VLDLRP98155 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VLDLRP98155 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VLDLRP98155 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VLDLRP98155 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VLDLRP98155 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VLDLRP98155 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VLDLRP98155 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VLDLRP98155 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VLDLRP98155 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VLDLRP98155 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VLDLRP98155 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VLDLRP98155 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VLDLRP98155 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VLDLRP98155 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VLDLRP98155 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VLDLRP98155 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VLDLRP98155 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VLDLRP98155 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VLDLRP98155 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VLDLRP98155 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VLDLRP98155 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VLDLRP98155 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VLDLRP98155 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VLDLRP98155 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VLDLRP98155 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VLDLRP98155 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VLDLRP98155 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VLDLRP98155 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VLDLRP98155 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms