Protein–RNA interactions for Protein: P62308

SNRPG, Small nuclear ribonucleoprotein G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPGP62308 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPGP62308 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPGP62308 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPGP62308 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPGP62308 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPGP62308 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPGP62308 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPGP62308 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPGP62308 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPGP62308 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPGP62308 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPGP62308 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPGP62308 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPGP62308 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPGP62308 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPGP62308 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPGP62308 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPGP62308 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPGP62308 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPGP62308 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPGP62308 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPGP62308 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPGP62308 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPGP62308 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPGP62308 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPGP62308 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPGP62308 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPGP62308 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPGP62308 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPGP62308 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPGP62308 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPGP62308 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPGP62308 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPGP62308 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPGP62308 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPGP62308 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPGP62308 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPGP62308 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPGP62308 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPGP62308 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPGP62308 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPGP62308 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNRPGP62308 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNRPGP62308 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPGP62308 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPGP62308 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPGP62308 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPGP62308 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPGP62308 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPGP62308 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPGP62308 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPGP62308 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPGP62308 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPGP62308 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPGP62308 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPGP62308 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPGP62308 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPGP62308 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPGP62308 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPGP62308 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPGP62308 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPGP62308 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPGP62308 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPGP62308 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPGP62308 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPGP62308 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPGP62308 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPGP62308 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPGP62308 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPGP62308 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPGP62308 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPGP62308 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPGP62308 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPGP62308 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPGP62308 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPGP62308 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPGP62308 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPGP62308 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRPGP62308 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPGP62308 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPGP62308 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPGP62308 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPGP62308 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPGP62308 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPGP62308 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRPGP62308 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPGP62308 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPGP62308 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPGP62308 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPGP62308 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPGP62308 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRPGP62308 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPGP62308 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPGP62308 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPGP62308 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPGP62308 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRPGP62308 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNRPGP62308 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRPGP62308 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRPGP62308 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms