Protein–RNA interactions for Protein: P62277

RPS13, 40S ribosomal protein S13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS13P62277 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS13P62277 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS13P62277 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS13P62277 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS13P62277 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS13P62277 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS13P62277 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS13P62277 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS13P62277 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS13P62277 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS13P62277 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS13P62277 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS13P62277 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS13P62277 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS13P62277 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS13P62277 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS13P62277 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS13P62277 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS13P62277 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS13P62277 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS13P62277 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPS13P62277 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPS13P62277 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS13P62277 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS13P62277 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS13P62277 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS13P62277 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS13P62277 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS13P62277 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS13P62277 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS13P62277 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS13P62277 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS13P62277 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS13P62277 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS13P62277 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS13P62277 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS13P62277 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS13P62277 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS13P62277 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS13P62277 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS13P62277 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS13P62277 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS13P62277 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS13P62277 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS13P62277 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS13P62277 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS13P62277 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS13P62277 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS13P62277 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS13P62277 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS13P62277 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS13P62277 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS13P62277 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS13P62277 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS13P62277 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS13P62277 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS13P62277 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS13P62277 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS13P62277 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS13P62277 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS13P62277 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS13P62277 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS13P62277 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS13P62277 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS13P62277 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS13P62277 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS13P62277 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS13P62277 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS13P62277 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS13P62277 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPS13P62277 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPS13P62277 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPS13P62277 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPS13P62277 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS13P62277 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS13P62277 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS13P62277 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS13P62277 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS13P62277 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS13P62277 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS13P62277 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS13P62277 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS13P62277 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS13P62277 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS13P62277 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS13P62277 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS13P62277 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS13P62277 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS13P62277 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS13P62277 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS13P62277 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPS13P62277 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPS13P62277 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS13P62277 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS13P62277 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS13P62277 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS13P62277 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS13P62277 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS13P62277 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS13P62277 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms