Protein–RNA interactions for Protein: P61266

STX1B, Syntaxin-1B, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1BP61266 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
STX1BP61266 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX1BP61266 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX1BP61266 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX1BP61266 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX1BP61266 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX1BP61266 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX1BP61266 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX1BP61266 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX1BP61266 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX1BP61266 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX1BP61266 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX1BP61266 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX1BP61266 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STX1BP61266 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
STX1BP61266 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STX1BP61266 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STX1BP61266 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STX1BP61266 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX1BP61266 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX1BP61266 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STX1BP61266 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STX1BP61266 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STX1BP61266 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STX1BP61266 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STX1BP61266 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STX1BP61266 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STX1BP61266 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STX1BP61266 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX1BP61266 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX1BP61266 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX1BP61266 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX1BP61266 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX1BP61266 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX1BP61266 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX1BP61266 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX1BP61266 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX1BP61266 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX1BP61266 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX1BP61266 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX1BP61266 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX1BP61266 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STX1BP61266 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STX1BP61266 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STX1BP61266 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STX1BP61266 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STX1BP61266 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STX1BP61266 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STX1BP61266 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STX1BP61266 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STX1BP61266 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STX1BP61266 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STX1BP61266 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STX1BP61266 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STX1BP61266 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX1BP61266 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX1BP61266 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX1BP61266 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX1BP61266 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
STX1BP61266 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STX1BP61266 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STX1BP61266 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STX1BP61266 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STX1BP61266 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STX1BP61266 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STX1BP61266 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX1BP61266 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX1BP61266 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
STX1BP61266 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX1BP61266 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX1BP61266 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX1BP61266 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX1BP61266 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX1BP61266 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX1BP61266 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX1BP61266 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX1BP61266 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX1BP61266 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX1BP61266 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX1BP61266 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX1BP61266 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX1BP61266 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX1BP61266 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
STX1BP61266 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX1BP61266 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX1BP61266 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX1BP61266 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX1BP61266 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX1BP61266 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX1BP61266 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX1BP61266 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX1BP61266 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX1BP61266 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX1BP61266 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX1BP61266 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX1BP61266 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX1BP61266 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX1BP61266 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX1BP61266 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX1BP61266 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms