Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2MP61081 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2MP61081 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UBE2MP61081 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2MP61081 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2MP61081 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2MP61081 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2MP61081 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2MP61081 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2MP61081 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2MP61081 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2MP61081 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UBE2MP61081 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2MP61081 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2MP61081 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2MP61081 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2MP61081 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2MP61081 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2MP61081 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2MP61081 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2MP61081 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2MP61081 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2MP61081 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2MP61081 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2MP61081 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2MP61081 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2MP61081 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2MP61081 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2MP61081 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2MP61081 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2MP61081 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2MP61081 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2MP61081 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2MP61081 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2MP61081 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2MP61081 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2MP61081 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2MP61081 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2MP61081 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2MP61081 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2MP61081 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2MP61081 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2MP61081 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2MP61081 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2MP61081 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2MP61081 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2MP61081 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2MP61081 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2MP61081 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2MP61081 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2MP61081 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2MP61081 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2MP61081 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2MP61081 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2MP61081 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2MP61081 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2MP61081 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2MP61081 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE2MP61081 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE2MP61081 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE2MP61081 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2MP61081 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2MP61081 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2MP61081 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2MP61081 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2MP61081 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2MP61081 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2MP61081 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2MP61081 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2MP61081 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2MP61081 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2MP61081 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2MP61081 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2MP61081 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2MP61081 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2MP61081 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2MP61081 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2MP61081 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2MP61081 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2MP61081 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2MP61081 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2MP61081 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2MP61081 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2MP61081 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2MP61081 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2MP61081 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2MP61081 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2MP61081 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2MP61081 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2MP61081 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2MP61081 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2MP61081 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2MP61081 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2MP61081 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2MP61081 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2MP61081 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2MP61081 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBE2MP61081 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBE2MP61081 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBE2MP61081 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms