Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB2AP61019 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB2AP61019 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB2AP61019 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB2AP61019 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB2AP61019 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB2AP61019 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB2AP61019 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB2AP61019 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB2AP61019 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB2AP61019 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB2AP61019 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB2AP61019 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB2AP61019 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB2AP61019 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB2AP61019 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB2AP61019 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB2AP61019 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB2AP61019 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB2AP61019 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB2AP61019 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB2AP61019 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB2AP61019 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB2AP61019 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB2AP61019 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB2AP61019 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB2AP61019 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB2AP61019 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB2AP61019 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB2AP61019 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB2AP61019 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB2AP61019 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB2AP61019 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB2AP61019 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB2AP61019 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB2AP61019 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB2AP61019 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB2AP61019 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB2AP61019 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB2AP61019 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB2AP61019 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB2AP61019 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB2AP61019 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB2AP61019 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB2AP61019 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB2AP61019 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB2AP61019 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB2AP61019 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB2AP61019 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB2AP61019 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB2AP61019 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB2AP61019 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB2AP61019 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB2AP61019 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB2AP61019 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB2AP61019 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB2AP61019 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB2AP61019 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB2AP61019 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB2AP61019 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB2AP61019 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB2AP61019 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB2AP61019 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB2AP61019 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms