Protein–RNA interactions for Protein: P60983

GMFB, Glia maturation factor beta, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMFBP60983 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GMFBP60983 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GMFBP60983 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GMFBP60983 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GMFBP60983 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GMFBP60983 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GMFBP60983 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GMFBP60983 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GMFBP60983 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GMFBP60983 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GMFBP60983 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GMFBP60983 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GMFBP60983 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GMFBP60983 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GMFBP60983 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GMFBP60983 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GMFBP60983 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GMFBP60983 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GMFBP60983 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GMFBP60983 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GMFBP60983 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GMFBP60983 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GMFBP60983 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GMFBP60983 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GMFBP60983 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GMFBP60983 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GMFBP60983 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GMFBP60983 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GMFBP60983 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GMFBP60983 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GMFBP60983 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GMFBP60983 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GMFBP60983 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GMFBP60983 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GMFBP60983 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GMFBP60983 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GMFBP60983 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GMFBP60983 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GMFBP60983 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GMFBP60983 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GMFBP60983 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GMFBP60983 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GMFBP60983 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GMFBP60983 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GMFBP60983 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GMFBP60983 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GMFBP60983 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GMFBP60983 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GMFBP60983 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GMFBP60983 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GMFBP60983 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GMFBP60983 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GMFBP60983 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GMFBP60983 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GMFBP60983 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GMFBP60983 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GMFBP60983 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GMFBP60983 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GMFBP60983 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GMFBP60983 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GMFBP60983 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GMFBP60983 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GMFBP60983 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GMFBP60983 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GMFBP60983 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GMFBP60983 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GMFBP60983 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GMFBP60983 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GMFBP60983 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GMFBP60983 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GMFBP60983 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GMFBP60983 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GMFBP60983 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GMFBP60983 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GMFBP60983 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GMFBP60983 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GMFBP60983 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GMFBP60983 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GMFBP60983 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GMFBP60983 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GMFBP60983 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GMFBP60983 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GMFBP60983 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GMFBP60983 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GMFBP60983 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GMFBP60983 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GMFBP60983 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GMFBP60983 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GMFBP60983 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GMFBP60983 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GMFBP60983 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GMFBP60983 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GMFBP60983 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GMFBP60983 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GMFBP60983 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GMFBP60983 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GMFBP60983 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GMFBP60983 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GMFBP60983 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GMFBP60983 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms