Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTXN1P60606 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTXN1P60606 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTXN1P60606 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTXN1P60606 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTXN1P60606 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTXN1P60606 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTXN1P60606 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTXN1P60606 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTXN1P60606 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTXN1P60606 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTXN1P60606 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTXN1P60606 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTXN1P60606 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTXN1P60606 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTXN1P60606 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTXN1P60606 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTXN1P60606 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTXN1P60606 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTXN1P60606 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTXN1P60606 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTXN1P60606 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTXN1P60606 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTXN1P60606 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTXN1P60606 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTXN1P60606 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTXN1P60606 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTXN1P60606 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTXN1P60606 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTXN1P60606 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTXN1P60606 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTXN1P60606 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTXN1P60606 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTXN1P60606 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTXN1P60606 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTXN1P60606 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTXN1P60606 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTXN1P60606 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTXN1P60606 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTXN1P60606 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTXN1P60606 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTXN1P60606 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTXN1P60606 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTXN1P60606 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTXN1P60606 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTXN1P60606 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTXN1P60606 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTXN1P60606 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTXN1P60606 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTXN1P60606 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTXN1P60606 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTXN1P60606 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTXN1P60606 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTXN1P60606 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTXN1P60606 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTXN1P60606 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTXN1P60606 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTXN1P60606 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTXN1P60606 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTXN1P60606 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTXN1P60606 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTXN1P60606 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTXN1P60606 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms