Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01547P58512 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01547P58512 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC01547P58512 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms