Protein–RNA interactions for Protein: P58418

CLRN1, Clarin-1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN1P58418 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLRN1P58418 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLRN1P58418 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLRN1P58418 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLRN1P58418 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLRN1P58418 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLRN1P58418 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLRN1P58418 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLRN1P58418 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLRN1P58418 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLRN1P58418 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLRN1P58418 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLRN1P58418 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLRN1P58418 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLRN1P58418 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLRN1P58418 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLRN1P58418 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLRN1P58418 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLRN1P58418 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLRN1P58418 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLRN1P58418 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLRN1P58418 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLRN1P58418 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLRN1P58418 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLRN1P58418 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLRN1P58418 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLRN1P58418 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLRN1P58418 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLRN1P58418 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLRN1P58418 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLRN1P58418 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLRN1P58418 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLRN1P58418 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLRN1P58418 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLRN1P58418 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLRN1P58418 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLRN1P58418 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLRN1P58418 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLRN1P58418 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLRN1P58418 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLRN1P58418 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLRN1P58418 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLRN1P58418 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLRN1P58418 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLRN1P58418 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLRN1P58418 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLRN1P58418 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLRN1P58418 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLRN1P58418 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLRN1P58418 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLRN1P58418 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLRN1P58418 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CLRN1P58418 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLRN1P58418 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLRN1P58418 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLRN1P58418 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLRN1P58418 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLRN1P58418 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLRN1P58418 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLRN1P58418 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLRN1P58418 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLRN1P58418 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLRN1P58418 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLRN1P58418 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLRN1P58418 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLRN1P58418 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLRN1P58418 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLRN1P58418 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLRN1P58418 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLRN1P58418 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLRN1P58418 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLRN1P58418 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLRN1P58418 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLRN1P58418 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLRN1P58418 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLRN1P58418 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLRN1P58418 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLRN1P58418 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLRN1P58418 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLRN1P58418 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLRN1P58418 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLRN1P58418 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLRN1P58418 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLRN1P58418 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLRN1P58418 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLRN1P58418 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLRN1P58418 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLRN1P58418 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLRN1P58418 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLRN1P58418 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLRN1P58418 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLRN1P58418 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLRN1P58418 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLRN1P58418 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLRN1P58418 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLRN1P58418 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLRN1P58418 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLRN1P58418 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLRN1P58418 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLRN1P58418 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms