Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAV3P56539 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAV3P56539 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAV3P56539 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAV3P56539 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAV3P56539 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAV3P56539 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAV3P56539 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAV3P56539 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAV3P56539 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAV3P56539 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAV3P56539 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAV3P56539 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAV3P56539 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAV3P56539 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAV3P56539 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAV3P56539 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAV3P56539 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAV3P56539 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAV3P56539 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAV3P56539 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAV3P56539 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAV3P56539 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAV3P56539 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAV3P56539 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAV3P56539 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAV3P56539 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAV3P56539 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAV3P56539 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CAV3P56539 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAV3P56539 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAV3P56539 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAV3P56539 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAV3P56539 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAV3P56539 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAV3P56539 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAV3P56539 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAV3P56539 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAV3P56539 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAV3P56539 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CAV3P56539 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAV3P56539 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAV3P56539 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAV3P56539 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAV3P56539 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAV3P56539 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAV3P56539 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAV3P56539 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAV3P56539 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAV3P56539 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAV3P56539 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAV3P56539 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAV3P56539 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAV3P56539 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAV3P56539 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAV3P56539 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAV3P56539 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAV3P56539 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAV3P56539 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAV3P56539 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAV3P56539 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAV3P56539 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAV3P56539 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAV3P56539 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAV3P56539 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAV3P56539 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAV3P56539 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAV3P56539 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAV3P56539 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAV3P56539 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAV3P56539 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAV3P56539 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAV3P56539 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAV3P56539 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAV3P56539 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAV3P56539 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAV3P56539 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAV3P56539 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAV3P56539 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAV3P56539 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAV3P56539 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAV3P56539 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAV3P56539 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAV3P56539 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAV3P56539 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAV3P56539 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CAV3P56539 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAV3P56539 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAV3P56539 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAV3P56539 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAV3P56539 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAV3P56539 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAV3P56539 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAV3P56539 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAV3P56539 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAV3P56539 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAV3P56539 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAV3P56539 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAV3P56539 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAV3P56539 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms