Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA1P56199 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA1P56199 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA1P56199 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ITGA1P56199 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ITGA1P56199 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA1P56199 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA1P56199 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA1P56199 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA1P56199 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA1P56199 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA1P56199 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA1P56199 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA1P56199 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA1P56199 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA1P56199 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA1P56199 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA1P56199 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA1P56199 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA1P56199 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA1P56199 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA1P56199 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA1P56199 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA1P56199 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA1P56199 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA1P56199 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA1P56199 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA1P56199 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA1P56199 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA1P56199 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA1P56199 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA1P56199 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA1P56199 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA1P56199 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA1P56199 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA1P56199 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA1P56199 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA1P56199 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA1P56199 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA1P56199 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA1P56199 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA1P56199 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA1P56199 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA1P56199 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA1P56199 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA1P56199 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA1P56199 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA1P56199 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA1P56199 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA1P56199 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA1P56199 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA1P56199 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA1P56199 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA1P56199 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA1P56199 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA1P56199 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA1P56199 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA1P56199 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITGA1P56199 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA1P56199 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA1P56199 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA1P56199 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA1P56199 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA1P56199 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA1P56199 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA1P56199 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA1P56199 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA1P56199 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA1P56199 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA1P56199 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA1P56199 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA1P56199 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA1P56199 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA1P56199 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA1P56199 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA1P56199 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA1P56199 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA1P56199 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA1P56199 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA1P56199 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA1P56199 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGA1P56199 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGA1P56199 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGA1P56199 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGA1P56199 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGA1P56199 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGA1P56199 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGA1P56199 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGA1P56199 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGA1P56199 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGA1P56199 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA1P56199 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA1P56199 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA1P56199 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA1P56199 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA1P56199 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA1P56199 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA1P56199 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA1P56199 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA1P56199 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA1P56199 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 248.7 ms