Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EMP3P54852 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EMP3P54852 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EMP3P54852 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EMP3P54852 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EMP3P54852 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EMP3P54852 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EMP3P54852 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EMP3P54852 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EMP3P54852 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EMP3P54852 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EMP3P54852 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EMP3P54852 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EMP3P54852 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EMP3P54852 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EMP3P54852 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EMP3P54852 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EMP3P54852 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EMP3P54852 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EMP3P54852 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMP3P54852 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMP3P54852 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMP3P54852 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMP3P54852 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMP3P54852 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMP3P54852 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMP3P54852 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMP3P54852 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMP3P54852 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EMP3P54852 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EMP3P54852 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EMP3P54852 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMP3P54852 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMP3P54852 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMP3P54852 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EMP3P54852 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMP3P54852 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMP3P54852 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMP3P54852 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMP3P54852 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMP3P54852 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMP3P54852 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMP3P54852 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMP3P54852 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMP3P54852 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMP3P54852 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMP3P54852 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMP3P54852 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMP3P54852 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EMP3P54852 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMP3P54852 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMP3P54852 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMP3P54852 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMP3P54852 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EMP3P54852 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EMP3P54852 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMP3P54852 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EMP3P54852 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMP3P54852 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EMP3P54852 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EMP3P54852 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EMP3P54852 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EMP3P54852 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EMP3P54852 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EMP3P54852 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EMP3P54852 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EMP3P54852 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EMP3P54852 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EMP3P54852 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EMP3P54852 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EMP3P54852 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EMP3P54852 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EMP3P54852 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EMP3P54852 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EMP3P54852 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EMP3P54852 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EMP3P54852 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EMP3P54852 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EMP3P54852 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EMP3P54852 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EMP3P54852 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EMP3P54852 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EMP3P54852 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EMP3P54852 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EMP3P54852 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EMP3P54852 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EMP3P54852 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EMP3P54852 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EMP3P54852 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EMP3P54852 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EMP3P54852 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EMP3P54852 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMP3P54852 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMP3P54852 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EMP3P54852 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EMP3P54852 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EMP3P54852 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EMP3P54852 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EMP3P54852 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMP3P54852 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms