Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RARSP54136 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RARSP54136 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RARSP54136 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RARSP54136 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RARSP54136 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
RARSP54136 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
RARSP54136 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RARSP54136 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
RARSP54136 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
RARSP54136 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
RARSP54136 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
RARSP54136 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RARSP54136 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RARSP54136 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RARSP54136 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RARSP54136 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RARSP54136 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RARSP54136 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RARSP54136 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RARSP54136 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RARSP54136 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RARSP54136 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RARSP54136 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RARSP54136 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RARSP54136 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RARSP54136 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RARSP54136 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
RARSP54136 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
RARSP54136 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
RARSP54136 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
RARSP54136 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RARSP54136 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RARSP54136 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RARSP54136 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RARSP54136 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RARSP54136 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RARSP54136 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RARSP54136 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RARSP54136 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RARSP54136 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RARSP54136 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
RARSP54136 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RARSP54136 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RARSP54136 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RARSP54136 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RARSP54136 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RARSP54136 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RARSP54136 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RARSP54136 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RARSP54136 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RARSP54136 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RARSP54136 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RARSP54136 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RARSP54136 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RARSP54136 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RARSP54136 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RARSP54136 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RARSP54136 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
RARSP54136 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RARSP54136 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RARSP54136 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RARSP54136 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RARSP54136 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
RARSP54136 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
RARSP54136 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RARSP54136 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RARSP54136 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RARSP54136 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RARSP54136 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
RARSP54136 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RARSP54136 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RARSP54136 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RARSP54136 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
RARSP54136 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RARSP54136 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RARSP54136 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RARSP54136 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RARSP54136 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RARSP54136 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RARSP54136 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RARSP54136 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RARSP54136 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RARSP54136 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RARSP54136 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RARSP54136 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RARSP54136 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RARSP54136 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
RARSP54136 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RARSP54136 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RARSP54136 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
RARSP54136 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
RARSP54136 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
RARSP54136 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
RARSP54136 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
RARSP54136 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
RARSP54136 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.78
RARSP54136 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
RARSP54136 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RARSP54136 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms