Protein–RNA interactions for Protein: P51812

RPS6KA3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA3P51812 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RPS6KA3P51812 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
RPS6KA3P51812 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS6KA3P51812 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS6KA3P51812 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS6KA3P51812 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS6KA3P51812 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS6KA3P51812 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KA3P51812 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KA3P51812 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KA3P51812 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KA3P51812 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KA3P51812 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KA3P51812 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KA3P51812 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KA3P51812 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KA3P51812 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KA3P51812 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KA3P51812 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KA3P51812 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KA3P51812 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KA3P51812 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KA3P51812 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KA3P51812 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms