Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR4P51679 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR4P51679 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR4P51679 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR4P51679 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR4P51679 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR4P51679 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR4P51679 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR4P51679 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR4P51679 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR4P51679 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR4P51679 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR4P51679 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR4P51679 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR4P51679 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR4P51679 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR4P51679 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR4P51679 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR4P51679 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR4P51679 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR4P51679 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR4P51679 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR4P51679 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR4P51679 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCR4P51679 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCR4P51679 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCR4P51679 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR4P51679 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR4P51679 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR4P51679 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR4P51679 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR4P51679 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR4P51679 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR4P51679 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR4P51679 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR4P51679 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR4P51679 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR4P51679 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR4P51679 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR4P51679 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR4P51679 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR4P51679 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR4P51679 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR4P51679 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR4P51679 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR4P51679 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR4P51679 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR4P51679 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCR4P51679 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCR4P51679 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCR4P51679 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCR4P51679 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCR4P51679 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCR4P51679 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCR4P51679 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCR4P51679 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCR4P51679 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCR4P51679 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCR4P51679 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCR4P51679 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCR4P51679 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCR4P51679 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCR4P51679 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCR4P51679 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR4P51679 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR4P51679 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR4P51679 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR4P51679 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR4P51679 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR4P51679 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR4P51679 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR4P51679 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR4P51679 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR4P51679 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR4P51679 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR4P51679 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR4P51679 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR4P51679 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR4P51679 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR4P51679 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR4P51679 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR4P51679 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR4P51679 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCR4P51679 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR4P51679 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR4P51679 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR4P51679 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR4P51679 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR4P51679 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR4P51679 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR4P51679 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR4P51679 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR4P51679 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR4P51679 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR4P51679 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR4P51679 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR4P51679 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR4P51679 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR4P51679 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCR4P51679 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms