Protein–RNA interactions for Protein: P48664

SLC1A6, Excitatory amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A6P48664 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC1A6P48664 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC1A6P48664 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC1A6P48664 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC1A6P48664 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC1A6P48664 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A6P48664 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A6P48664 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A6P48664 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A6P48664 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A6P48664 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC1A6P48664 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC1A6P48664 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC1A6P48664 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC1A6P48664 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC1A6P48664 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC1A6P48664 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC1A6P48664 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC1A6P48664 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC1A6P48664 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC1A6P48664 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC1A6P48664 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC1A6P48664 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC1A6P48664 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC1A6P48664 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC1A6P48664 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC1A6P48664 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC1A6P48664 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC1A6P48664 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC1A6P48664 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC1A6P48664 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC1A6P48664 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC1A6P48664 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC1A6P48664 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC1A6P48664 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC1A6P48664 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A6P48664 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A6P48664 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A6P48664 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A6P48664 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A6P48664 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A6P48664 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC1A6P48664 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC1A6P48664 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC1A6P48664 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC1A6P48664 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC1A6P48664 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC1A6P48664 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC1A6P48664 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC1A6P48664 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC1A6P48664 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC1A6P48664 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC1A6P48664 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC1A6P48664 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC1A6P48664 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC1A6P48664 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC1A6P48664 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC1A6P48664 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A6P48664 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A6P48664 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A6P48664 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A6P48664 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A6P48664 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC1A6P48664 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC1A6P48664 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC1A6P48664 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC1A6P48664 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC1A6P48664 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A6P48664 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A6P48664 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A6P48664 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC1A6P48664 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC1A6P48664 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC1A6P48664 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC1A6P48664 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC1A6P48664 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC1A6P48664 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC1A6P48664 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC1A6P48664 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC1A6P48664 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC1A6P48664 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC1A6P48664 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC1A6P48664 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC1A6P48664 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC1A6P48664 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC1A6P48664 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC1A6P48664 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC1A6P48664 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC1A6P48664 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC1A6P48664 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC1A6P48664 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC1A6P48664 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC1A6P48664 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC1A6P48664 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC1A6P48664 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC1A6P48664 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC1A6P48664 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC1A6P48664 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC1A6P48664 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC1A6P48664 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms