Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ETV4P43268 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ETV4P43268 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ETV4P43268 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ETV4P43268 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ETV4P43268 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ETV4P43268 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ETV4P43268 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ETV4P43268 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ETV4P43268 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ETV4P43268 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ETV4P43268 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ETV4P43268 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ETV4P43268 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ETV4P43268 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ETV4P43268 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ETV4P43268 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ETV4P43268 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ETV4P43268 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ETV4P43268 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ETV4P43268 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ETV4P43268 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ETV4P43268 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ETV4P43268 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ETV4P43268 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ETV4P43268 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ETV4P43268 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ETV4P43268 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ETV4P43268 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ETV4P43268 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ETV4P43268 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ETV4P43268 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ETV4P43268 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ETV4P43268 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ETV4P43268 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ETV4P43268 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ETV4P43268 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ETV4P43268 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ETV4P43268 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ETV4P43268 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ETV4P43268 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ETV4P43268 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ETV4P43268 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ETV4P43268 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ETV4P43268 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ETV4P43268 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ETV4P43268 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ETV4P43268 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ETV4P43268 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ETV4P43268 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ETV4P43268 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ETV4P43268 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ETV4P43268 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ETV4P43268 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ETV4P43268 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ETV4P43268 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ETV4P43268 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ETV4P43268 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ETV4P43268 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ETV4P43268 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ETV4P43268 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ETV4P43268 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ETV4P43268 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ETV4P43268 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ETV4P43268 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ETV4P43268 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ETV4P43268 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ETV4P43268 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ETV4P43268 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ETV4P43268 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ETV4P43268 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ETV4P43268 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ETV4P43268 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ETV4P43268 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ETV4P43268 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ETV4P43268 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ETV4P43268 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ETV4P43268 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ETV4P43268 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ETV4P43268 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ETV4P43268 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ETV4P43268 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ETV4P43268 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ETV4P43268 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ETV4P43268 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ETV4P43268 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ETV4P43268 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ETV4P43268 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ETV4P43268 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ETV4P43268 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ETV4P43268 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ETV4P43268 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ETV4P43268 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ETV4P43268 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ETV4P43268 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ETV4P43268 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ETV4P43268 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ETV4P43268 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ETV4P43268 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ETV4P43268 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms