Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTGIRP43119 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTGIRP43119 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTGIRP43119 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTGIRP43119 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTGIRP43119 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTGIRP43119 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTGIRP43119 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTGIRP43119 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTGIRP43119 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTGIRP43119 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTGIRP43119 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTGIRP43119 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTGIRP43119 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTGIRP43119 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTGIRP43119 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTGIRP43119 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTGIRP43119 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTGIRP43119 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTGIRP43119 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTGIRP43119 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTGIRP43119 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTGIRP43119 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTGIRP43119 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PTGIRP43119 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTGIRP43119 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTGIRP43119 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTGIRP43119 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTGIRP43119 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTGIRP43119 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTGIRP43119 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTGIRP43119 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTGIRP43119 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTGIRP43119 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTGIRP43119 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTGIRP43119 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTGIRP43119 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTGIRP43119 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTGIRP43119 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTGIRP43119 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTGIRP43119 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTGIRP43119 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTGIRP43119 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTGIRP43119 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTGIRP43119 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTGIRP43119 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTGIRP43119 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PTGIRP43119 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTGIRP43119 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTGIRP43119 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTGIRP43119 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTGIRP43119 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PTGIRP43119 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTGIRP43119 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTGIRP43119 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTGIRP43119 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTGIRP43119 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTGIRP43119 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTGIRP43119 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTGIRP43119 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTGIRP43119 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTGIRP43119 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTGIRP43119 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTGIRP43119 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTGIRP43119 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTGIRP43119 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTGIRP43119 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTGIRP43119 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PTGIRP43119 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGIRP43119 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGIRP43119 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGIRP43119 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGIRP43119 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGIRP43119 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGIRP43119 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGIRP43119 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTGIRP43119 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTGIRP43119 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTGIRP43119 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTGIRP43119 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PTGIRP43119 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGIRP43119 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGIRP43119 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGIRP43119 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGIRP43119 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGIRP43119 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGIRP43119 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGIRP43119 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGIRP43119 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGIRP43119 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGIRP43119 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGIRP43119 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGIRP43119 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGIRP43119 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGIRP43119 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGIRP43119 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGIRP43119 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGIRP43119 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGIRP43119 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGIRP43119 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms