Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP2P42575 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CASP2P42575 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CASP2P42575 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASP2P42575 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASP2P42575 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASP2P42575 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASP2P42575 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CASP2P42575 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASP2P42575 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASP2P42575 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP2P42575 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP2P42575 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP2P42575 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP2P42575 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP2P42575 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP2P42575 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP2P42575 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP2P42575 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP2P42575 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP2P42575 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP2P42575 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP2P42575 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP2P42575 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP2P42575 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP2P42575 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP2P42575 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP2P42575 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP2P42575 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP2P42575 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP2P42575 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP2P42575 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASP2P42575 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASP2P42575 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASP2P42575 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASP2P42575 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP2P42575 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP2P42575 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP2P42575 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP2P42575 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP2P42575 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP2P42575 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP2P42575 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP2P42575 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP2P42575 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP2P42575 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP2P42575 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP2P42575 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP2P42575 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP2P42575 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP2P42575 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP2P42575 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP2P42575 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP2P42575 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP2P42575 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP2P42575 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP2P42575 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP2P42575 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP2P42575 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP2P42575 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP2P42575 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP2P42575 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP2P42575 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP2P42575 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP2P42575 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP2P42575 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP2P42575 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP2P42575 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CASP2P42575 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP2P42575 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP2P42575 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP2P42575 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP2P42575 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP2P42575 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP2P42575 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP2P42575 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP2P42575 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP2P42575 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP2P42575 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP2P42575 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP2P42575 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP2P42575 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP2P42575 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP2P42575 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP2P42575 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP2P42575 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP2P42575 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP2P42575 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP2P42575 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP2P42575 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP2P42575 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP2P42575 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP2P42575 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP2P42575 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP2P42575 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP2P42575 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP2P42575 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP2P42575 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP2P42575 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP2P42575 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms