Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MDH1P40925 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MDH1P40925 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MDH1P40925 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MDH1P40925 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MDH1P40925 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MDH1P40925 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MDH1P40925 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MDH1P40925 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MDH1P40925 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MDH1P40925 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MDH1P40925 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MDH1P40925 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MDH1P40925 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MDH1P40925 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MDH1P40925 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MDH1P40925 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MDH1P40925 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MDH1P40925 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MDH1P40925 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MDH1P40925 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MDH1P40925 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MDH1P40925 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MDH1P40925 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MDH1P40925 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MDH1P40925 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MDH1P40925 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MDH1P40925 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MDH1P40925 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MDH1P40925 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MDH1P40925 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MDH1P40925 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MDH1P40925 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MDH1P40925 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MDH1P40925 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MDH1P40925 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MDH1P40925 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MDH1P40925 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MDH1P40925 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MDH1P40925 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MDH1P40925 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MDH1P40925 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MDH1P40925 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MDH1P40925 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MDH1P40925 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MDH1P40925 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MDH1P40925 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MDH1P40925 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MDH1P40925 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MDH1P40925 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MDH1P40925 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MDH1P40925 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MDH1P40925 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MDH1P40925 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MDH1P40925 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MDH1P40925 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MDH1P40925 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MDH1P40925 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MDH1P40925 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MDH1P40925 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MDH1P40925 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MDH1P40925 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MDH1P40925 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MDH1P40925 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MDH1P40925 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MDH1P40925 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MDH1P40925 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MDH1P40925 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MDH1P40925 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MDH1P40925 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MDH1P40925 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MDH1P40925 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MDH1P40925 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MDH1P40925 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MDH1P40925 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MDH1P40925 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MDH1P40925 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MDH1P40925 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MDH1P40925 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MDH1P40925 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MDH1P40925 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MDH1P40925 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MDH1P40925 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MDH1P40925 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MDH1P40925 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MDH1P40925 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MDH1P40925 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MDH1P40925 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MDH1P40925 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MDH1P40925 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MDH1P40925 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MDH1P40925 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MDH1P40925 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MDH1P40925 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MDH1P40925 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MDH1P40925 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MDH1P40925 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MDH1P40925 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MDH1P40925 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MDH1P40925 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms