Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NUP62P37198 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP62P37198 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP62P37198 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP62P37198 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP62P37198 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP62P37198 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP62P37198 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP62P37198 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NUP62P37198 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP62P37198 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP62P37198 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP62P37198 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP62P37198 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP62P37198 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP62P37198 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUP62P37198 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP62P37198 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP62P37198 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP62P37198 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP62P37198 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUP62P37198 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP62P37198 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP62P37198 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP62P37198 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUP62P37198 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP62P37198 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP62P37198 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP62P37198 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP62P37198 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP62P37198 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUP62P37198 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP62P37198 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP62P37198 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP62P37198 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP62P37198 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP62P37198 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP62P37198 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP62P37198 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP62P37198 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP62P37198 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP62P37198 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP62P37198 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP62P37198 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP62P37198 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP62P37198 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP62P37198 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP62P37198 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP62P37198 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP62P37198 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP62P37198 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP62P37198 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP62P37198 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP62P37198 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP62P37198 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP62P37198 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP62P37198 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP62P37198 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP62P37198 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP62P37198 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP62P37198 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP62P37198 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP62P37198 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP62P37198 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP62P37198 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP62P37198 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NUP62P37198 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NUP62P37198 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP62P37198 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP62P37198 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP62P37198 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP62P37198 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP62P37198 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP62P37198 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP62P37198 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP62P37198 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP62P37198 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP62P37198 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP62P37198 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP62P37198 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP62P37198 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP62P37198 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP62P37198 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP62P37198 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP62P37198 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP62P37198 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP62P37198 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP62P37198 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP62P37198 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP62P37198 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP62P37198 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP62P37198 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP62P37198 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP62P37198 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP62P37198 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP62P37198 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP62P37198 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP62P37198 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP62P37198 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP62P37198 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms