Protein–RNA interactions for Protein: P35442

THBS2, Thrombospondin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS2P35442 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THBS2P35442 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THBS2P35442 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THBS2P35442 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THBS2P35442 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THBS2P35442 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THBS2P35442 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THBS2P35442 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THBS2P35442 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THBS2P35442 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THBS2P35442 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THBS2P35442 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THBS2P35442 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THBS2P35442 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THBS2P35442 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THBS2P35442 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THBS2P35442 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THBS2P35442 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THBS2P35442 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THBS2P35442 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THBS2P35442 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THBS2P35442 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THBS2P35442 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THBS2P35442 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THBS2P35442 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
THBS2P35442 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THBS2P35442 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THBS2P35442 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THBS2P35442 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THBS2P35442 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THBS2P35442 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THBS2P35442 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THBS2P35442 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
THBS2P35442 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THBS2P35442 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THBS2P35442 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THBS2P35442 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THBS2P35442 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THBS2P35442 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THBS2P35442 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THBS2P35442 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THBS2P35442 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THBS2P35442 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THBS2P35442 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THBS2P35442 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THBS2P35442 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THBS2P35442 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THBS2P35442 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THBS2P35442 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THBS2P35442 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
THBS2P35442 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THBS2P35442 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THBS2P35442 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THBS2P35442 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THBS2P35442 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THBS2P35442 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THBS2P35442 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THBS2P35442 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THBS2P35442 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THBS2P35442 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THBS2P35442 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THBS2P35442 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THBS2P35442 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THBS2P35442 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THBS2P35442 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
THBS2P35442 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
THBS2P35442 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
THBS2P35442 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THBS2P35442 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THBS2P35442 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THBS2P35442 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THBS2P35442 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THBS2P35442 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THBS2P35442 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THBS2P35442 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THBS2P35442 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THBS2P35442 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THBS2P35442 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
THBS2P35442 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THBS2P35442 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THBS2P35442 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THBS2P35442 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THBS2P35442 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THBS2P35442 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THBS2P35442 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THBS2P35442 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THBS2P35442 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THBS2P35442 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THBS2P35442 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THBS2P35442 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THBS2P35442 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THBS2P35442 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THBS2P35442 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
THBS2P35442 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THBS2P35442 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THBS2P35442 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
THBS2P35442 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
THBS2P35442 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THBS2P35442 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THBS2P35442 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms