Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RORAP35398 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RORAP35398 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RORAP35398 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RORAP35398 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RORAP35398 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RORAP35398 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RORAP35398 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RORAP35398 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RORAP35398 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RORAP35398 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RORAP35398 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RORAP35398 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RORAP35398 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RORAP35398 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RORAP35398 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RORAP35398 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RORAP35398 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RORAP35398 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RORAP35398 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RORAP35398 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RORAP35398 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RORAP35398 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RORAP35398 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RORAP35398 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RORAP35398 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RORAP35398 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RORAP35398 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RORAP35398 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RORAP35398 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RORAP35398 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RORAP35398 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RORAP35398 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RORAP35398 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RORAP35398 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RORAP35398 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RORAP35398 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RORAP35398 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RORAP35398 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RORAP35398 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RORAP35398 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RORAP35398 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RORAP35398 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RORAP35398 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RORAP35398 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RORAP35398 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RORAP35398 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RORAP35398 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RORAP35398 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RORAP35398 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RORAP35398 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RORAP35398 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RORAP35398 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RORAP35398 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RORAP35398 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RORAP35398 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RORAP35398 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RORAP35398 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RORAP35398 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RORAP35398 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RORAP35398 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RORAP35398 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RORAP35398 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RORAP35398 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RORAP35398 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RORAP35398 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RORAP35398 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RORAP35398 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RORAP35398 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RORAP35398 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RORAP35398 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RORAP35398 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RORAP35398 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RORAP35398 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RORAP35398 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RORAP35398 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RORAP35398 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RORAP35398 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RORAP35398 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RORAP35398 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RORAP35398 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RORAP35398 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RORAP35398 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RORAP35398 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RORAP35398 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RORAP35398 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RORAP35398 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RORAP35398 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RORAP35398 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RORAP35398 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RORAP35398 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RORAP35398 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RORAP35398 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RORAP35398 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RORAP35398 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RORAP35398 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RORAP35398 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RORAP35398 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RORAP35398 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RORAP35398 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 413.7 ms