Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DSG3P32926 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DSG3P32926 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DSG3P32926 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DSG3P32926 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
DSG3P32926 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DSG3P32926 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DSG3P32926 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DSG3P32926 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DSG3P32926 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
DSG3P32926 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
DSG3P32926 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DSG3P32926 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DSG3P32926 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DSG3P32926 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DSG3P32926 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
DSG3P32926 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
DSG3P32926 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DSG3P32926 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DSG3P32926 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DSG3P32926 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DSG3P32926 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DSG3P32926 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DSG3P32926 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DSG3P32926 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DSG3P32926 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DSG3P32926 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DSG3P32926 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DSG3P32926 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DSG3P32926 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DSG3P32926 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DSG3P32926 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DSG3P32926 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DSG3P32926 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DSG3P32926 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DSG3P32926 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DSG3P32926 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DSG3P32926 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DSG3P32926 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DSG3P32926 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DSG3P32926 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
DSG3P32926 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
DSG3P32926 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DSG3P32926 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DSG3P32926 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DSG3P32926 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DSG3P32926 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DSG3P32926 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DSG3P32926 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
DSG3P32926 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DSG3P32926 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DSG3P32926 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DSG3P32926 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DSG3P32926 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DSG3P32926 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DSG3P32926 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DSG3P32926 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DSG3P32926 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DSG3P32926 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DSG3P32926 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
DSG3P32926 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DSG3P32926 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DSG3P32926 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DSG3P32926 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DSG3P32926 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DSG3P32926 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DSG3P32926 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DSG3P32926 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DSG3P32926 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DSG3P32926 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DSG3P32926 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DSG3P32926 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DSG3P32926 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DSG3P32926 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DSG3P32926 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DSG3P32926 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DSG3P32926 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
DSG3P32926 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
DSG3P32926 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DSG3P32926 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
DSG3P32926 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DSG3P32926 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DSG3P32926 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DSG3P32926 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DSG3P32926 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
DSG3P32926 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DSG3P32926 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DSG3P32926 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DSG3P32926 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DSG3P32926 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DSG3P32926 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
DSG3P32926 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
DSG3P32926 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DSG3P32926 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DSG3P32926 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
DSG3P32926 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DSG3P32926 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DSG3P32926 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DSG3P32926 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DSG3P32926 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms