Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCKARP32238 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCKARP32238 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCKARP32238 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCKARP32238 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCKARP32238 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCKARP32238 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCKARP32238 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCKARP32238 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCKARP32238 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCKARP32238 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCKARP32238 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCKARP32238 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCKARP32238 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCKARP32238 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCKARP32238 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCKARP32238 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCKARP32238 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCKARP32238 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCKARP32238 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCKARP32238 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCKARP32238 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCKARP32238 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCKARP32238 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCKARP32238 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCKARP32238 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCKARP32238 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCKARP32238 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCKARP32238 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCKARP32238 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCKARP32238 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCKARP32238 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCKARP32238 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCKARP32238 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCKARP32238 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCKARP32238 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCKARP32238 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCKARP32238 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCKARP32238 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCKARP32238 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCKARP32238 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCKARP32238 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCKARP32238 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCKARP32238 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCKARP32238 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCKARP32238 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCKARP32238 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCKARP32238 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCKARP32238 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCKARP32238 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCKARP32238 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCKARP32238 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCKARP32238 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCKARP32238 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCKARP32238 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCKARP32238 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCKARP32238 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCKARP32238 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCKARP32238 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCKARP32238 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCKARP32238 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCKARP32238 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCKARP32238 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCKARP32238 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCKARP32238 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCKARP32238 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCKARP32238 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCKARP32238 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCKARP32238 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCKARP32238 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCKARP32238 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCKARP32238 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCKARP32238 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCKARP32238 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCKARP32238 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCKARP32238 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCKARP32238 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCKARP32238 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCKARP32238 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCKARP32238 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCKARP32238 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCKARP32238 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCKARP32238 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCKARP32238 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCKARP32238 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCKARP32238 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCKARP32238 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCKARP32238 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCKARP32238 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCKARP32238 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCKARP32238 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCKARP32238 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCKARP32238 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCKARP32238 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCKARP32238 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCKARP32238 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCKARP32238 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCKARP32238 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCKARP32238 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCKARP32238 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms