Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP11P24347 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP11P24347 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP11P24347 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP11P24347 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP11P24347 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP11P24347 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP11P24347 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP11P24347 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP11P24347 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP11P24347 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP11P24347 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP11P24347 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP11P24347 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP11P24347 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP11P24347 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP11P24347 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP11P24347 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MMP11P24347 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MMP11P24347 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP11P24347 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP11P24347 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP11P24347 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP11P24347 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP11P24347 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP11P24347 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP11P24347 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP11P24347 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP11P24347 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP11P24347 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP11P24347 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP11P24347 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP11P24347 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP11P24347 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP11P24347 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP11P24347 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP11P24347 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP11P24347 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP11P24347 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP11P24347 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP11P24347 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP11P24347 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP11P24347 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP11P24347 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP11P24347 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP11P24347 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP11P24347 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP11P24347 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP11P24347 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP11P24347 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP11P24347 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP11P24347 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP11P24347 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP11P24347 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP11P24347 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP11P24347 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP11P24347 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP11P24347 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMP11P24347 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMP11P24347 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMP11P24347 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MMP11P24347 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP11P24347 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP11P24347 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP11P24347 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP11P24347 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP11P24347 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP11P24347 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP11P24347 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP11P24347 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP11P24347 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP11P24347 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP11P24347 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP11P24347 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP11P24347 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP11P24347 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP11P24347 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MMP11P24347 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MMP11P24347 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP11P24347 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP11P24347 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP11P24347 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP11P24347 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP11P24347 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP11P24347 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP11P24347 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP11P24347 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP11P24347 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP11P24347 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP11P24347 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP11P24347 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP11P24347 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP11P24347 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP11P24347 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP11P24347 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP11P24347 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP11P24347 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP11P24347 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP11P24347 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP11P24347 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms