Protein–RNA interactions for Protein: P22223

CDH3, Cadherin-3, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH3P22223 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH3P22223 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH3P22223 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH3P22223 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH3P22223 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH3P22223 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH3P22223 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH3P22223 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH3P22223 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH3P22223 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH3P22223 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH3P22223 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDH3P22223 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDH3P22223 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH3P22223 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH3P22223 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH3P22223 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH3P22223 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH3P22223 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH3P22223 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH3P22223 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH3P22223 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH3P22223 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH3P22223 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH3P22223 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH3P22223 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH3P22223 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH3P22223 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH3P22223 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH3P22223 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH3P22223 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH3P22223 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH3P22223 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH3P22223 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH3P22223 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH3P22223 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH3P22223 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH3P22223 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH3P22223 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH3P22223 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH3P22223 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH3P22223 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH3P22223 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH3P22223 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH3P22223 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDH3P22223 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH3P22223 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH3P22223 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH3P22223 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH3P22223 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH3P22223 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH3P22223 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH3P22223 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH3P22223 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH3P22223 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH3P22223 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH3P22223 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH3P22223 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH3P22223 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH3P22223 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH3P22223 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH3P22223 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH3P22223 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH3P22223 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH3P22223 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH3P22223 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH3P22223 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH3P22223 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH3P22223 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH3P22223 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH3P22223 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH3P22223 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH3P22223 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH3P22223 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH3P22223 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH3P22223 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH3P22223 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH3P22223 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH3P22223 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH3P22223 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH3P22223 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH3P22223 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH3P22223 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH3P22223 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH3P22223 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH3P22223 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH3P22223 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH3P22223 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH3P22223 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH3P22223 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH3P22223 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH3P22223 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH3P22223 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH3P22223 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH3P22223 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH3P22223 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH3P22223 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH3P22223 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH3P22223 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH3P22223 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms