Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NCLP19338 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NCLP19338 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NCLP19338 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NCLP19338 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NCLP19338 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NCLP19338 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NCLP19338 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NCLP19338 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NCLP19338 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NCLP19338 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NCLP19338 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NCLP19338 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NCLP19338 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCLP19338 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCLP19338 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCLP19338 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NCLP19338 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NCLP19338 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NCLP19338 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NCLP19338 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NCLP19338 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NCLP19338 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NCLP19338 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NCLP19338 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NCLP19338 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
NCLP19338 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NCLP19338 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NCLP19338 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NCLP19338 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NCLP19338 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NCLP19338 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NCLP19338 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NCLP19338 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCLP19338 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCLP19338 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCLP19338 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCLP19338 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NCLP19338 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NCLP19338 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NCLP19338 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NCLP19338 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NCLP19338 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NCLP19338 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NCLP19338 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NCLP19338 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NCLP19338 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
NCLP19338 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
NCLP19338 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NCLP19338 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NCLP19338 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NCLP19338 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NCLP19338 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NCLP19338 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NCLP19338 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NCLP19338 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NCLP19338 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NCLP19338 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NCLP19338 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NCLP19338 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCLP19338 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCLP19338 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCLP19338 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCLP19338 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
NCLP19338 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCLP19338 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCLP19338 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCLP19338 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCLP19338 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCLP19338 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCLP19338 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCLP19338 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NCLP19338 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NCLP19338 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCLP19338 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCLP19338 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCLP19338 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCLP19338 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NCLP19338 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCLP19338 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCLP19338 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCLP19338 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCLP19338 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NCLP19338 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCLP19338 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCLP19338 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCLP19338 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCLP19338 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCLP19338 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCLP19338 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCLP19338 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NCLP19338 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCLP19338 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCLP19338 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCLP19338 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCLP19338 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCLP19338 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
NCLP19338 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NCLP19338 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NCLP19338 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms