Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB6P18564 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB6P18564 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB6P18564 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB6P18564 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB6P18564 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB6P18564 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB6P18564 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB6P18564 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB6P18564 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB6P18564 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB6P18564 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB6P18564 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB6P18564 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB6P18564 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB6P18564 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB6P18564 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB6P18564 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB6P18564 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB6P18564 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB6P18564 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB6P18564 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB6P18564 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB6P18564 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB6P18564 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB6P18564 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB6P18564 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB6P18564 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB6P18564 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB6P18564 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB6P18564 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB6P18564 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB6P18564 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB6P18564 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB6P18564 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB6P18564 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB6P18564 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB6P18564 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB6P18564 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGB6P18564 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGB6P18564 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB6P18564 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB6P18564 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB6P18564 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB6P18564 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB6P18564 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB6P18564 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB6P18564 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB6P18564 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB6P18564 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB6P18564 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB6P18564 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB6P18564 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB6P18564 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB6P18564 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB6P18564 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB6P18564 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB6P18564 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB6P18564 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB6P18564 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB6P18564 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB6P18564 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB6P18564 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB6P18564 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB6P18564 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB6P18564 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB6P18564 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB6P18564 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB6P18564 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB6P18564 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB6P18564 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB6P18564 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ITGB6P18564 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB6P18564 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB6P18564 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB6P18564 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB6P18564 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB6P18564 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB6P18564 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB6P18564 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB6P18564 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB6P18564 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB6P18564 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB6P18564 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB6P18564 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB6P18564 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB6P18564 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB6P18564 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB6P18564 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB6P18564 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB6P18564 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB6P18564 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB6P18564 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGB6P18564 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB6P18564 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB6P18564 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB6P18564 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGB6P18564 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB6P18564 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGB6P18564 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms