Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AMD1P17707 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AMD1P17707 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
AMD1P17707 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AMD1P17707 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AMD1P17707 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AMD1P17707 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AMD1P17707 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AMD1P17707 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AMD1P17707 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
AMD1P17707 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AMD1P17707 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AMD1P17707 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AMD1P17707 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AMD1P17707 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AMD1P17707 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AMD1P17707 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AMD1P17707 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AMD1P17707 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AMD1P17707 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AMD1P17707 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AMD1P17707 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AMD1P17707 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
AMD1P17707 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AMD1P17707 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AMD1P17707 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AMD1P17707 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AMD1P17707 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AMD1P17707 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AMD1P17707 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AMD1P17707 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AMD1P17707 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AMD1P17707 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AMD1P17707 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AMD1P17707 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AMD1P17707 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
AMD1P17707 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AMD1P17707 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AMD1P17707 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AMD1P17707 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
AMD1P17707 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AMD1P17707 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AMD1P17707 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMD1P17707 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMD1P17707 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMD1P17707 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMD1P17707 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMD1P17707 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMD1P17707 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMD1P17707 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMD1P17707 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMD1P17707 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMD1P17707 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMD1P17707 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMD1P17707 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMD1P17707 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMD1P17707 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMD1P17707 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMD1P17707 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMD1P17707 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMD1P17707 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMD1P17707 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMD1P17707 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMD1P17707 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMD1P17707 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMD1P17707 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMD1P17707 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMD1P17707 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMD1P17707 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
AMD1P17707 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMD1P17707 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMD1P17707 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
AMD1P17707 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMD1P17707 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMD1P17707 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMD1P17707 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMD1P17707 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMD1P17707 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMD1P17707 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMD1P17707 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMD1P17707 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMD1P17707 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMD1P17707 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMD1P17707 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMD1P17707 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMD1P17707 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMD1P17707 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMD1P17707 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AMD1P17707 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AMD1P17707 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AMD1P17707 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AMD1P17707 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AMD1P17707 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AMD1P17707 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
AMD1P17707 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
AMD1P17707 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AMD1P17707 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AMD1P17707 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AMD1P17707 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMD1P17707 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms