Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNT1P13805 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNT1P13805 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNT1P13805 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNT1P13805 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNT1P13805 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNT1P13805 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNT1P13805 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNT1P13805 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNT1P13805 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNT1P13805 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNT1P13805 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNT1P13805 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNT1P13805 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNT1P13805 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNT1P13805 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNT1P13805 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNT1P13805 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNT1P13805 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNT1P13805 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNT1P13805 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNT1P13805 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNT1P13805 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNT1P13805 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNT1P13805 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TNNT1P13805 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNNT1P13805 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNNT1P13805 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNNT1P13805 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNT1P13805 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNT1P13805 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNT1P13805 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNT1P13805 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNT1P13805 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNT1P13805 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNT1P13805 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNT1P13805 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNT1P13805 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNT1P13805 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNT1P13805 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNT1P13805 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNT1P13805 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNT1P13805 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNT1P13805 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNT1P13805 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNNT1P13805 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TNNT1P13805 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNNT1P13805 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TNNT1P13805 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNNT1P13805 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNNT1P13805 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNNT1P13805 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNNT1P13805 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TNNT1P13805 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNNT1P13805 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TNNT1P13805 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNNT1P13805 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TNNT1P13805 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNNT1P13805 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNNT1P13805 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNNT1P13805 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TNNT1P13805 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNNT1P13805 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNNT1P13805 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNNT1P13805 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNNT1P13805 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.51■■■□□ 2
TNNT1P13805 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNT1P13805 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNT1P13805 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNT1P13805 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNT1P13805 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNT1P13805 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNT1P13805 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNT1P13805 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNT1P13805 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNT1P13805 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNT1P13805 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNT1P13805 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNT1P13805 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNNT1P13805 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNT1P13805 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNT1P13805 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNT1P13805 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNT1P13805 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNNT1P13805 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNNT1P13805 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNNT1P13805 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNT1P13805 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNT1P13805 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNT1P13805 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNT1P13805 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNT1P13805 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNT1P13805 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNT1P13805 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNT1P13805 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNT1P13805 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNT1P13805 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNT1P13805 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNT1P13805 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNT1P13805 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms